基于主成分和聚类分析的冀花高油酸花生品种综合评价

S565.2; 利用3年表型和重测序数据分别对11个冀花高油酸花生品种进行主成分分析和聚类分析.结果发现,15个性状中脂肪含量变异系数最小为1.91％,除亚油酸外产量性状变异均大于品质变异系数,百果重与百仁重呈极显著正相关,油酸和亚油酸呈极显著负相关.主成分分析提取的前2个主成分累计贡献率达78.99％,利用表型性状对品种进行分类,结果与系谱关系部分一致.质控后获得320000个分布均匀的高质量SNP位点,利用基因型数据将11个品种聚为4类,能够将同一组合衍生品种划分为同一类,结果与品种系谱关系一致.因此,利用基因型数据更能准确反映品种内在遗传基础,为种质资源的分类和利用提供参考....

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Published in中国油料作物学报 Vol. 44; no. 6; pp. 1210 - 1217
Main Authors 郭敏杰, 邓丽, 李玉荣, 王瑾, 任丽
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 开封市农林科学研究院,河南开封,475000%河北省农林科学院粮油作物研究所,河北石家庄,050035 2022
Subjects
主成分分析
SNP位点
表型
高油酸
聚类分析
花生
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ISSN1007-9084
DOI10.19802/j.issn.1007-9084.2022191

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Summary:S565.2; 利用3年表型和重测序数据分别对11个冀花高油酸花生品种进行主成分分析和聚类分析.结果发现,15个性状中脂肪含量变异系数最小为1.91％,除亚油酸外产量性状变异均大于品质变异系数,百果重与百仁重呈极显著正相关,油酸和亚油酸呈极显著负相关.主成分分析提取的前2个主成分累计贡献率达78.99％,利用表型性状对品种进行分类,结果与系谱关系部分一致.质控后获得320000个分布均匀的高质量SNP位点,利用基因型数据将11个品种聚为4类,能够将同一组合衍生品种划分为同一类,结果与品种系谱关系一致.因此,利用基因型数据更能准确反映品种内在遗传基础,为种质资源的分类和利用提供参考.
ISSN:1007-9084
DOI:10.19802/j.issn.1007-9084.2022191