基于DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶的物种鉴定

目的 运用DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶进行物种鉴定.方法 通过对 26 份鱼胶样品基因组DNA提取,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增细胞色素C氧化酶I(cytochrome c oxidase,COI)基因、测序,用生命条形码数据(barcode of life data,BOLD)物种鉴定系统,与数据库中已有鱼类序列进行比对分析,鉴定出各鱼胶的物种;根据 Kimura 双参数模型计算样品序列遗传距离,并将所得序列使用邻接法(neighbor-joining,NJ)和最大简约法(maximum parsimony,MP)构建系统发育树,进行...

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Published in食品安全质量检测学报 Vol. 14; no. 14; pp. 236 - 244
Main Authors 叶晓康, 李艳芬, 董慧, 王树启, 温小波, 林帆
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 汕头大学海洋科学研究院, 广东省海洋生物技术重点实验室, 汕头 515063%汕头市鱼胶海味协会,汕头 515063%汕头市颐膳美食品有限公司, 汕头 515031%华南农业大学海洋学院, 广州 510642 2023
Subjects
石首鱼科
COI基因
species identification
fish maw
物种鉴定
DNA barcoding
Sciaenidae
COI gene
鱼胶
DNA条形码
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ISSN2095-0381

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Summary:目的 运用DNA条形码技术对常见石首鱼科鱼胶进行物种鉴定.方法 通过对 26 份鱼胶样品基因组DNA提取,聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增细胞色素C氧化酶I(cytochrome c oxidase,COI)基因、测序,用生命条形码数据(barcode of life data,BOLD)物种鉴定系统,与数据库中已有鱼类序列进行比对分析,鉴定出各鱼胶的物种;根据 Kimura 双参数模型计算样品序列遗传距离,并将所得序列使用邻接法(neighbor-joining,NJ)和最大简约法(maximum parsimony,MP)构建系统发育树,进行聚类分析.结果 26 份鱼胶样品通过鉴定引物"Fish-F""Fish-R"均可实现扩增,条带清晰,扩增和测序成功率均为 100%;BOLD 鉴定结果显示,26份鱼胶样品中23份能够确定物种来源(相似性达98%以上),包括石首鱼科12属15种鱼类,且多数为外来物种,另外 3 份鱼胶可推测其近缘物种.此外,系统发育树聚类分析结果与物种鉴定结果一致.结论 目前石首鱼类鱼胶来源物种较多,且多为外来基原鱼种.DNA 条形码技术与 BOLD 鉴定系统相结合,可对大部分鱼胶进行准确的物种鉴定.
ISSN:2095-0381