单分子实时测序技术研究不同来源原料乳中群落组成及多样性

目的 采用三代单分子实时测序法(single molecule real time sequencing,SMRT)研究北京和内蒙古两地原料乳中的细菌群落组成及多样性,解析其携带污染菌的差异,为原料乳质量及风险评估提供基础数据.方法 收集北京和内蒙古两地春夏季和秋冬季的原料乳样品20份,采用SMRT技术对其进行基于16S rDNA基因全长的测序和多样性分析.在此基础上,对其进行了微生物相关功能性预测.结果 不同产地与不同采样季节原料乳中细菌群落的结构组成和相对丰度存在差异,假单胞菌属、不动杆菌属与乳球菌属是大部分样品中相对丰度最高的细菌,其中脆弱假单胞菌的相对丰度与原料乳冷链运输时间正相关.功...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in食品安全质量检测学报 Vol. 13; no. 4; pp. 1123 - 1131
Main Authors 梁丽姣, 王娉, 曲天铭, 赵晓美, 姬庆龙, 陈颖
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 南京财经大学食品科学与工程学院, 南京 210023 2022
中国检验检疫科学研究院, 北京 100176%中国检验检疫科学研究院, 北京 100176
Subjects
单分子实时测序;原料乳;细菌组成;功能预测
Online AccessGet full text
ISSN2095-0381

Cover

More Information
Summary:目的 采用三代单分子实时测序法(single molecule real time sequencing,SMRT)研究北京和内蒙古两地原料乳中的细菌群落组成及多样性,解析其携带污染菌的差异,为原料乳质量及风险评估提供基础数据.方法 收集北京和内蒙古两地春夏季和秋冬季的原料乳样品20份,采用SMRT技术对其进行基于16S rDNA基因全长的测序和多样性分析.在此基础上,对其进行了微生物相关功能性预测.结果 不同产地与不同采样季节原料乳中细菌群落的结构组成和相对丰度存在差异,假单胞菌属、不动杆菌属与乳球菌属是大部分样品中相对丰度最高的细菌,其中脆弱假单胞菌的相对丰度与原料乳冷链运输时间正相关.功能预测揭示了原料乳脂肪质量可能具有地区差异性,维生素与氨基酸质量可能具有季节差异性.结论 两产地原料乳菌群分析结果提示了原料乳潜在的食品安全风险,并且除致病菌风险之外耐药菌及耐药基因传播的风险同样不容忽视;此外,乳球菌属细菌具有开发作为益生菌的潜力.本研究结果为原料乳的质量安全监测评估和功能菌种挖掘提供了参考依据.
ISSN:2095-0381