核转录因子NFYB和NFYC促进红系终末分化

R34; 目的 利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子,并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究.方法 使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据,结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调控因子.利用公共测序数据集重点分析预测出的NFYB和NFYC在人与小鼠红系终末分化不同阶段中的表达;荧光激活细胞分选技术(FACS)分选小鼠胎肝体外红系终末分化各阶段的细胞,检测Nfyb和Nfyc的表达水平.在小鼠胎肝红系分化体系中使用慢病毒感染,分别敲低Nfyb和Nfyc,检测红系终末分化及脱核的变化.结果 通过SCENIC分析预测出NFYB和NFY...

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Published in基础医学与临床 Vol. 42; no. 6; pp. 920 - 926
Main Authors 余东林, 杨希, 阴佳滢, 刘雪会, 吕湘
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国医学科学院基础医学研究所 北京协和医学院基础学院 病理生理学系 医学分子生物学国家重点实验室,北京100005 2022
Subjects
SCENIC
NFYB
NFYC
红系终末分化
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ISSN1001-6325
DOI10.3969/j.issn.1001-6325.2022.06.011

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Summary:R34; 目的 利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子,并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究.方法 使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据,结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调控因子.利用公共测序数据集重点分析预测出的NFYB和NFYC在人与小鼠红系终末分化不同阶段中的表达;荧光激活细胞分选技术(FACS)分选小鼠胎肝体外红系终末分化各阶段的细胞,检测Nfyb和Nfyc的表达水平.在小鼠胎肝红系分化体系中使用慢病毒感染,分别敲低Nfyb和Nfyc,检测红系终末分化及脱核的变化.结果 通过SCENIC分析预测出NFYB和NFYC是红系终末分化早期的调控因子,在人与小鼠的红系终末分化早期表达较高,晚期则降低.在小鼠胎肝体外红系分化体系中分别敲低Nfyb和Nfyc,均可显著抑制红系终末分化(P<0.05)及脱核(P<0.05).结论 NFYB和NFYC促进红系终末分化过程.
ISSN:1001-6325
DOI:10.3969/j.issn.1001-6325.2022.06.011