香石竹DcSKP1基因克隆及表达分析

Q943; SKP1基因是SCF E3泛素连接酶蛋白复合物的核心成分,参与多种生物过程.然而,香石竹SKP1基因还未被克隆,该文利用RT-PCR结合RACE技术,从香石竹(Dianthus caryophyllus)的花药中分离克隆了1个减数分裂相关基因SKP1的全长cDNA序列,命名为DcSKP1(GenBank登录号为MK931293).结果表明:(1)DcSKP1基因cDNA全长序列为962 bp,含有1个长度为567 bp的ORF,该基因编码188个氨基酸.(2)蛋白序列比对显示,DcSKP1中存在一个高度保守TPEE基序,还具有Skp1 POZ结构域和Skp1结构域,并与拟南芥的SK...

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Published in广西植物 Vol. 42; no. 2; pp. 286 - 293
Main Authors 周旭红, 赵雪艳, 杨晓密, 吴学尉, 瞿素萍
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 云南省农业科学院 花卉研究所,昆明 650205 2022
云南中医药大学 科技处,昆明 650500%云南大学 农学院,昆明 650500%云南中医药大学 科技处,昆明 650500%云南省农业科学院 花卉研究所,昆明 650205
Subjects
香石竹;DcSKP1;减数分裂;生物信息学分析;基因表达分析
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ISSN1000-3142
DOI10.11931/guihaia.gxzw202003044

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Summary:Q943; SKP1基因是SCF E3泛素连接酶蛋白复合物的核心成分,参与多种生物过程.然而,香石竹SKP1基因还未被克隆,该文利用RT-PCR结合RACE技术,从香石竹(Dianthus caryophyllus)的花药中分离克隆了1个减数分裂相关基因SKP1的全长cDNA序列,命名为DcSKP1(GenBank登录号为MK931293).结果表明:(1)DcSKP1基因cDNA全长序列为962 bp,含有1个长度为567 bp的ORF,该基因编码188个氨基酸.(2)蛋白序列比对显示,DcSKP1中存在一个高度保守TPEE基序,还具有Skp1 POZ结构域和Skp1结构域,并与拟南芥的SKP1聚集在一个分支上.(3)利用荧光定量PCR对香石竹DcSKP1基因表达模式进行研究,发现DcSKP1基因在各个组织部位都有表达,在花药中的表达量高于茎、叶组织,且在幼小的花药中表达量最高,随着花药发育的进程表达量下降.由此推测,DcSKP1基因可能在香石竹减数分裂中具有重要作用.
ISSN:1000-3142
DOI:10.11931/guihaia.gxzw202003044