2022-2023年我国部分地区猪A群轮状病毒分子流行病学调查分析

• Published in: 南方农业学报 Vol. 54; no. 10; pp. 3083 - 3091
• Main Authors: 谷拉强, 陶然, 程曦, 张雪寒, 周金柱, 王丹丹, 王建新, 李彬
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 河北农业大学动物医学院,河北保定 071000 2023; 江苏省农业科学院兽医研究所,江苏南京 210014%江苏省农业科学院兽医研究所,江苏南京 210014
• Subjects: molecular epidemiology; group A porcine rotavirus; VP4基因; 分子流行病学; 猪A群轮状病毒; VP4 gene; VP7 gene; VP7基因
• ISSN: 2095-1191
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2023.10.027

S852.651; [目的]探究我国部分地区猪A群轮状病毒(RVA)的分子流行病学特征,明确当前的优势基因型,为RVA科学防控与疫苗研发提供理论依据.[方法]2022年1月—2023年3月收集江苏、江西、福建、山西和贵州5省36个规模化猪场送检的434份腹泻仔猪粪便样品,采用RT-PCR检测样品RVA阳性情况,对部分RVA阳性样品的VP7和VP4基因进行扩增及测序,与各型参考序列进行多序列比对,使用MegAlign进行核苷酸序列同源比对分析,并采用MEGA 7.0的邻接法构建系统发育进化树.[结果]RT-PCR检测结果显示,434份腹泻仔猪粪便样品中RVA阳性样品为196份,阳性检出率为45.16%.2022年与2023年初的阳性检出率分别为40.37%(132/327)和59.81%(64/107).根据样品来源地区,RVA阳性检出率最高的是江苏(57.70%),其次是江西(55.71%),福建、贵州和山西的RVA阳性检出率分别是35.66%、30.00%和22.23%.共获得各地区12株RVA的VP4和VP7基因序列信息,遗传进化分析结果表明,G型中G9为优势基因型(占83.4%),G4和G5分别占8.3%;而P型中P7为优势基因型(占75.0%),其次为P13和P23,分别占16.7%和8.3%;12株RVA分属4种基因型组合,分别为G9P[7](占75.0%)、G5P[13](占8.3%)、G9P[13](占8.3%)和G4P[23](占8.3%).[结论]我国部分省份猪场RVA阳性检出率持续升高,猪群中RVA基因型复杂多样,优势基因型组合为G9P[7].因此,今后有必要对猪群中RVA的流行情况进行持续监测,结合基因型致病性制定预防措施并开发针对性疫苗.