基于启发式算法和支持向量机算法预测醛类化合物急性毒性

O6; 应用启发式算法(HM)和支持向量机算法(SVM)建立了88种醛类化合物对大鼠急性毒性的定量构效关系模型.应用ChemOffice 2004 软件进行化合物的结构输入,利用半经验方法进行分子结构优化,在CODDESA软件中计算出组成、拓扑、几何、电子和量子化学参数.并用启发式方法筛选出相对阳性电荷、氧原子数量、碳原子的最小亲核反应指数、双键相对数量、碳原子数量、碳氢键之间的最大交换能量、最大σ-σ键序和双键数量8个参数,在此基础上应该多元线性回归和支持向量机方法建立QSPR模型.两种方法均得到了较好的结果,HM和SVM的交互检验的相关系数分别为0.90和0.93;通过对模型的稳定性和预测...

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Published in分析化学 Vol. 35; no. 9; pp. 1263 - 1268
Main Authors 张克俊, 孙守迁, 柴春雷, 司宏宗
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 浙江大学计算机学院,杭州,310027%青岛大学计算科学与工程技术研究中心,材料与现代纺织国家重点实验室培育基地,青岛,266071 2007
Subjects
支持向量机
启发式算法
定量构效关系
醛
急性毒性
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ISSN0253-3820
DOI10.3321/j.issn:0253-3820.2007.09.005

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Summary:O6; 应用启发式算法(HM)和支持向量机算法(SVM)建立了88种醛类化合物对大鼠急性毒性的定量构效关系模型.应用ChemOffice 2004 软件进行化合物的结构输入,利用半经验方法进行分子结构优化,在CODDESA软件中计算出组成、拓扑、几何、电子和量子化学参数.并用启发式方法筛选出相对阳性电荷、氧原子数量、碳原子的最小亲核反应指数、双键相对数量、碳原子数量、碳氢键之间的最大交换能量、最大σ-σ键序和双键数量8个参数,在此基础上应该多元线性回归和支持向量机方法建立QSPR模型.两种方法均得到了较好的结果,HM和SVM的交互检验的相关系数分别为0.90和0.93;通过对模型的稳定性和预测能力比较,SVM建立的QSAR模型能够更好地预测醛类化合物对大鼠急性毒性LD50.
ISSN:0253-3820
DOI:10.3321/j.issn:0253-3820.2007.09.005