基于16S rRNA序列推断红蹼树蛙、棱皮树蛙和白斑小树蛙的非单系性
Q951.3%Q959.5%Q349; 测定了4个种(红蹼树蛙、黑蹼树蛙、白斑小树蛙和红吸盘小树蛙)共11个种群的16S rRNA基因片段.双斑树蛙、马来棱皮树蛙、越南棱皮树蛙以及日本溪树蛙的同源序列通过GenBank检索获得.去除所有插入、缺失及模糊位点后,比对序列长度为500 bp,其中变异位点115个,简约信息位点92个.以日本溪树蛙为外群,运用Bayesian法、MP法和ML法构建了系统发育树.结果表明红蹼树蛙和白斑小树蛙在种级水平上均不是单系.红蹼树蛙海南种群与双斑树蛙亲缘关系更近,并且来自云南不同地理种群的红蹼树蛙可以分为两大支系;越南棱皮树蛙与红吸盘小树蛙聚为一支,马来棱皮树蛙嵌...
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| Published in | 动物学研究 Vol. 28; no. 4; pp. 437 - 442 |
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| Main Authors | , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
中国科学院研究生院,北京,100039%中国科学院昆明动物研究所,云南,昆明,650223
2007
中国科学院昆明动物研究所,云南,昆明,650223 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 0254-5853 |
| DOI | 10.3321/j.issn:0254-5853.2007.04.015 |
Cover
| Summary: | Q951.3%Q959.5%Q349; 测定了4个种(红蹼树蛙、黑蹼树蛙、白斑小树蛙和红吸盘小树蛙)共11个种群的16S rRNA基因片段.双斑树蛙、马来棱皮树蛙、越南棱皮树蛙以及日本溪树蛙的同源序列通过GenBank检索获得.去除所有插入、缺失及模糊位点后,比对序列长度为500 bp,其中变异位点115个,简约信息位点92个.以日本溪树蛙为外群,运用Bayesian法、MP法和ML法构建了系统发育树.结果表明红蹼树蛙和白斑小树蛙在种级水平上均不是单系.红蹼树蛙海南种群与双斑树蛙亲缘关系更近,并且来自云南不同地理种群的红蹼树蛙可以分为两大支系;越南棱皮树蛙与红吸盘小树蛙聚为一支,马来棱皮树蛙嵌套在白斑小树蛙不同地理种群中.进而认为白斑小树蛙是马来棱皮树蛙的同物异名,建议将红吸盘小树蛙并入棱皮树蛙属. |
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| ISSN: | 0254-5853 |
| DOI: | 10.3321/j.issn:0254-5853.2007.04.015 |