EST-SSR构建益母草栽培种指纹图谱及遗传多样性

Q663.4; 为了对益母草品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,试验采用EST-SSR(Ex-pressed Sequence Tag-Simple Sequence Repeats)分子标记技术构建了生产上常用的10个益母草栽培品种的数字指纹图谱及遗传多样性分析.试验共筛选出13对益母草EST-SSR分子标记,检测等位位点61个,其中含多态性位点52个,多态性比率为85.2％.EST-SSR引物扩增2～11个等位位点,平均每对引物扩增4.69个基因型,扩增条带100～600 bp,多态信息含量(PIC)0.551,基因流(Nm)1.319,平均杂合率0.647.从13对引物中,筛选出...

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Published in辽东学院学报（自然科学版） Vol. 27; no. 3; pp. 165 - 170
Main Authors 王丹丹, 王鹏
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 辽东学院 农学院,辽宁 丹东 118003 2020
Subjects
遗传多样性
EST-SSR标记
益母草
聚类分析
指纹图谱
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ISSN1673-4939
DOI10.14168/j.issn.1673-4939.2020.03.03

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Summary:Q663.4; 为了对益母草品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,试验采用EST-SSR(Ex-pressed Sequence Tag-Simple Sequence Repeats)分子标记技术构建了生产上常用的10个益母草栽培品种的数字指纹图谱及遗传多样性分析.试验共筛选出13对益母草EST-SSR分子标记,检测等位位点61个,其中含多态性位点52个,多态性比率为85.2％.EST-SSR引物扩增2～11个等位位点,平均每对引物扩增4.69个基因型,扩增条带100～600 bp,多态信息含量(PIC)0.551,基因流(Nm)1.319,平均杂合率0.647.从13对引物中,筛选出5对核心引物,即LJ17、LJ21、LJ29、LJ47和LJ62,以引物组合方式构建指纹图谱可区分10个品种;聚类分析表明在遗传距离0.66处10个品种被分为3类,聚类结果与品种的来源具有较高的一致性.
ISSN:1673-4939
DOI:10.14168/j.issn.1673-4939.2020.03.03