CHARACTERIZATION OF MCRA SUBUNITS AND USES THEREOF

• Main Authors: ANTON, BRIAN, P, RALEIGH, ELISABETH, A
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 16.02.2006
• Edition: 7
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIREDCHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERSFROM A RACEMIC MIXTURE; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS; VINEGAR; WINE

Compositions and methods are provided in which the composition is a protein with at least 50% but less than 100% amino acid sequence identity with McrA or is a variant McrA protein with at least one amino acid sequence modification. The variant or protein has the property of cleaving DNA with methylated cytosine and not hydroxymethylated cytosine in a target DNA sequence, or substantially lacks catalytic activity while maintaining binding activity. Methods are provided in which the protein or McrA variant are used to identify methylation sites either by cleavage or by binding to the methylation site in the presence of a marker or by binding to an immobilized protein or McrA variant. Des compositions et des procédés faisant intervenir une composition qui est une protéine avec au moins 50 % mais moins de 100 % d'une identité de séquence d'acides aminés avec McrA ou qui est une variante de la protéine McrA avec au moins une modification de la séquence d'acides aminés. La variante ou la protéine a la propriété de cliver l'ADN avec une cytosine méthylée et une cytosine non hydroxyméthylée dans une séquence d'ADN cible, ou fait preuve d'un manque considérable d'activité catalytique tout en conservant l'activité de liaison. Les procédés consistant à utiliser la protéine ou la variante McrA pour identifier les sites de méthylation par clivage ou par liaison au site de méthylation en présence d'un marqueur ou par liaison à une protéine immobilisée ou à une variante McrA.