日本落叶松种子萌发过程中18个miRNAs的表达变化

运用qRT—PCR技术，检测日本落叶松种子萌发过程中的5个阶段——干种子（萌发培养0d）、吸胀（1d）、萌动（5d）、胚根外露（9d）和子叶展开（28d），miRl56、miRl59和miRl60等18个miRNAs在其种胚内的表达模式，并对其目标基因进行生物信息学分析，探讨miRNA在针叶林木种子萌发过程中的基因表达模式。结果表明：（1）从整个萌发过程分析，18个miRNAs的表达水平皆以干种子阶段最高，吸胀和萌动阶段迅速下降；干种子阶段的表达水平分别是吸胀、萌动、胚根外露和子叶展开阶段的4．8～43．5、17．2～1000．0、45．5～1000．0、62．5～1862．2倍。（2）从各个...

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Published in林业科学研究 Vol. 26; no. 10; pp. 9 - 17
Main Author 吴涛 韩素英 张俊红 李万峰 杨文华 齐力旺
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 2013
Subjects
miRNA
qRT—PCR
日本落叶松
种子
萌发
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ISSN1001-1498

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Summary:运用qRT—PCR技术，检测日本落叶松种子萌发过程中的5个阶段——干种子（萌发培养0d）、吸胀（1d）、萌动（5d）、胚根外露（9d）和子叶展开（28d），miRl56、miRl59和miRl60等18个miRNAs在其种胚内的表达模式，并对其目标基因进行生物信息学分析，探讨miRNA在针叶林木种子萌发过程中的基因表达模式。结果表明：（1）从整个萌发过程分析，18个miRNAs的表达水平皆以干种子阶段最高，吸胀和萌动阶段迅速下降；干种子阶段的表达水平分别是吸胀、萌动、胚根外露和子叶展开阶段的4．8～43．5、17．2～1000．0、45．5～1000．0、62．5～1862．2倍。（2）从各个阶段分析，miR894的表达水平在5个阶段均最高，miR408均最低；其余16个miRNAs在5个阶段内的表达水平各有变化，综合排序结果从高到低依次为：miR951、miR950、miRl56、miRl59、miR396、miR398、miR390、miRl60、miR947、miRl65、miR319、miRl62、miRl71、miR397、miR395和miRl72。（3）miRNA目标基因预测结果显示：目标基因主要是ATP／DNA结合蛋白、ARF等转录因子、质膜和核糖体等细胞组分及MAP等激酶活性蛋白等蛋白编码基因。（4）miRl60对其目标基因JRl60237具有切割作用，切割位点发生在miRl60与目标基因互补结合位点第10与11位碱基之间。JRl60237在种子吸胀阶段表达水平迅速升高，在萌动、胚根外露和成苗阶段有所回落。
Bibliography:11-1221/S
miRNA ; Larix kaempferi ; seed; germination; qRT-PCR
The seed of Larix kaempferi （ Siebold. ＆ Zucc. ） Gordon was used as material to investigate the potential molecular regulation mechanisms of miRNA during seed germination. The germination process of L. kaempferi seed includes the following： The imbibition of dry seed was completed after 24 hours of socking; the testa rupture oc- curred after 5 days and followed by radicle emergence （ videlicet, endosperm rupture） after 9 days of germination culture ; the cotyledons expanded fully after 28 days. The expression level of 18 miRNAs was relatively quantified u- sing qRT-PCR technology among five key seed germinating stages, which including dry seed （0 day after germina- ting）, imbibed seed （1st day after germinating）, testa rupture （Sth day）, radicle emergence （9th day） and coty- ledon extension （28th day）. The results are as follows. （ 1 ）The expression levels of 18 miRNAs were the highest at dry seed stage and then went down rapidly at imbibed seed and
ISSN:1001-1498