菸草嵌紋病毒矮牽牛分離株之特性分析

• Published in: 植物病理學會刊 Vol. 21; no. 4; pp. 249 - 258
• Main Authors: 黃千純(C. T. Huang), 王惠亮(H. L. Wang)
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 中華民國植物病理學會 01.12.2012
• Subjects: nucleotide sequence; Tobacco mosaic virus; 核苷酸序列; 菸草嵌紋病毒; open reading frame; 矮牽牛; petunia; 開放轉譯架構
• ISSN: 1021-9544
• DOI: 10.6649/PPB.201212_21(3_4).0007

矮牽牛（petunia，Petunia x hybrida）植株具有疑似黃化和嵌紋病徵。經三次單斑分離後得一病毒株，以間接酵素結合抗體檢定法檢測，與菸草嵌紋病毒（Tobacco mosaic virus，TMV）抗體呈陽性反應。病毒株以TMV pet-TW稱之。TMV pet-TW 經機械接種可以感染茄科植物，並可在奎藜、紅藜、菸草、蕃茄、茄子、辣椒、千日紅及雞冠花等植物引起局部性病斑。病毒顆粒為直桿狀，大小約300 x 18 nm。病毒的基因體RNA 為單一分子，約6.4 kb。SDSPAGE顯示病毒鞘蛋白的相對分子量約為17.5 kDa，該蛋白於西方轉漬免疫分析時與TMV 之抗體有正反應。譯讀TMV pet-TW 的基因序列得全長序列含核苷酸6349 核苷酸（accession number: EF392659），其鹼基組成包含1883 個A（29.65%）、1218 個C（19.18%）、1495 個G（23.54 %）、1753 個T（27.61%）。TMV pet-TW 基因組RNA 有四個開放轉譯架構，分別為RdRp（RNA-dependent RNA polymerase）/replicase protein、RdRp/readthrough protein、MP（movement protein）和CP（coat protein）。比較TMV pet-TW 與他種菸草嵌紋病毒（TMV）各基因之核苷酸序列相同度及胺基酸序列相似度，結果顯示其確為菸草嵌紋病毒的矮牽牛分離株。核苷酸或胺基酸序列比對結果可知，TMV pet-TW（accession number: EF392659）與TMV 的B（AJ011933）、variant 1（V01408）、NC 82（X68110）、Fujian（AF395127）和Rakkyo（D63809）等分離株較為相近。研究結果亦顯示TMV pet-TW 之MP基因核苷酸和胺基酸序列數目與已知的異源TMV 分離株有差異。