水稻遗传育种相关生物信息数据库和工具的研究进展

S511%S32; 水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式植物.面对日益严峻的环境和人口压力,培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径.随着多组学技术的快速发展,积累了海量的水稻遗传育种相关的数据.生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体,用以整合、可视化和共享数据,并为数据的深入挖掘和利用提供工具,从而为育种决策提供数据支撑.本综述系统梳理了近 20 年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结.最后,讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足,并对它们在大数据...

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Published in华南农业大学学报 Vol. 44; no. 6; pp. 854 - 866
Main Authors 彭歆, 钱乾, 谭健韬, 彭波, 甘玉立, 王成睿, 刘琦, 沈梦圆
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广东省农业科学院水稻研究所/广东省水稻育种新技术重点实验室/广东省水稻工程实验室/农业农村部华南优质稻遗传育种实验室(部省共建),广东广州 510640 2023
Subjects
生物信息数据库
遗传育种
Online analysis tool
Bioinformatics database
水稻
Genetics and breeding
在线分析工具
Rice
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ISSN1001-411X
DOI10.7671/j.issn.1001-411X.202306065

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Summary:S511%S32; 水稻Oryza sativa L.是主要的粮食作物,也是单子叶植物研究的模式植物.面对日益严峻的环境和人口压力,培育高产、优质、环境适性强的水稻品种是解决当前粮食安全问题的有效途径.随着多组学技术的快速发展,积累了海量的水稻遗传育种相关的数据.生物信息数据库和在线分析工具是存储这些数据的载体,用以整合、可视化和共享数据,并为数据的深入挖掘和利用提供工具,从而为育种决策提供数据支撑.本综述系统梳理了近 20 年来开发的水稻生物信息数据库和在线分析工具,并基于内置数据集和功能对它们进行了分类和总结.最后,讨论了现有的水稻生物信息数据库和在线分析工具的问题与不足,并对它们在大数据和人工智能时代的发展方向进行了展望.
ISSN:1001-411X
DOI:10.7671/j.issn.1001-411X.202306065