基于eDNA技术的珠海外伶仃海洋牧场细菌多样性研究

• Published in: 广东农业科学 Vol. 50; no. 2; pp. 67 - 75
• Main Authors: 臧能玮, 朱爱意, 陈丕茂, 袁华荣, 张红会, 魏文迪
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江 舟山 316022 2023; 上海海洋大学海洋科学学院,上海 201306; 中国水产科学院南海水产科学研究所,广东 广州 510300%浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心,浙江 舟山 316022%中国水产科学院南海水产科学研究所,广东 广州 510300%中国水产科学院南海水产科学研究所,广东 广州 510300
• Subjects: 多样性; eDNA; 优势度; 海洋牧场; 微生物; PCR扩增
• ISSN: 1004-874X
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2023.02.008

Q933; [目的]探索珠海外伶仃海洋牧场微生物群落组成、序列数、生物多样性等,分析eDNA技术的灵敏度,为珠海外伶仃海洋牧场生态系统管理维护提供参考.[方法]2021年9月在珠海外伶仃海洋牧场设立9个站位点,在表层水下2 m处采样,并对样品进行预处理、DNA提取、PCR扩增、高通量测序,分析微生物种类组成、微生物资源密度和丰度,确定优势种.[结果]通过eDNA技术共检出珠海外伶仃海洋牧场微生物30种,隶属于5门7纲14目19科26属,共检测出779706个OTU(Operational Taxonomic Units).变形菌门为绝对优势门(占75.06％),其次分别是拟杆菌门(占11.35％)、厚壁菌门(占5.28％)、浮霉菌门(占1.91％)、放线菌门(占1.06％);优势种共有7种,分别是交替假单胞菌、海杆菌、莫拉克氏菌、嗜冷菌、溶藻弧菌、嗜盐单胞菌、鞘氨醇杆菌,其中溶藻弧菌优势度最高(0.19)、为绝对优势种,其次是交替假单胞菌和莫拉克氏菌,优势度分别达到0.13、0.12,为主要优势种.[结论]研究结果揭示了珠海外伶仃海洋牧场的微生物群落信息,探索了eDNA技术在海洋牧场的应用,印证了该技术的高效性和灵敏度,为海洋牧场微生物方面的研究提供基础数据和科学参考.