低氧环境下C10orf10对胶质瘤生长和预后的影响
目的:胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,低氧微环境在实体肿瘤中普遍存在.本研究旨在探讨在低氧环境中发生上调的相关基因及其对胶质瘤生长和预后的影响.方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中筛选胶质瘤与低氧相关的数据集,通过生物信息学分析低氧处理与非低氧处理之间的差异表达基因,并在低氧处理后的细胞中通过real-time PCR和蛋白质印迹法来验证并筛选出C10orf10(chromosome 10 open reading frame 10)基因.下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)以及中国脑胶质瘤图谱(Ch...
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| Published in | 中南大学学报(医学版) Vol. 48; no. 4; pp. 499 - 507 |
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| Main Authors | , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
中南大学湘雅医院神经外科,长沙 410008%中山大学附属第三医院神经外科,广州 510000
2023
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| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1672-7347 |
| DOI | 10.11817/j.issn.1672-7347.2023.220396 |
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| Summary: | 目的:胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,低氧微环境在实体肿瘤中普遍存在.本研究旨在探讨在低氧环境中发生上调的相关基因及其对胶质瘤生长和预后的影响.方法:在基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中筛选胶质瘤与低氧相关的数据集,通过生物信息学分析低氧处理与非低氧处理之间的差异表达基因,并在低氧处理后的细胞中通过real-time PCR和蛋白质印迹法来验证并筛选出C10orf10(chromosome 10 open reading frame 10)基因.下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)以及中国脑胶质瘤图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)数据库中胶质瘤样本数据集,分析在不同级别胶质瘤中C10orf10 mRNA的表达及其对胶质瘤预后的影响.收集2017年3月至2021年1月在中南大学湘雅医院行手术治疗的68例胶质瘤患者的瘤组织标本及随访数据,采用real-time PCR检测不同级别胶质瘤中C10orf10 mRNA的表达,再结合Kaplan-Meier法分析C10orf10与胶质瘤预后之间的关系.构建干扰C10orf10表达的胶质瘤细胞系,采用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)及克隆形成实验评估C10orf10对胶质瘤细胞增殖的影响.结果:与常氧条件下相比,在低氧环境下胶质瘤细胞系能够显著上调C10orf10 mRNA和蛋白质水平(均P<0.001),且胶质瘤组织中C10orf10 mRNA表达水平随着WHO分级的增高而上调(P<0.001).生存分析发现C10orf10 mRNA表达水平越高,患者的生存期则越短(P<0.05).并且,在CGGA中,C10orf10 mRNA表达水平在复发胶质瘤中较原发胶质瘤中表达高(P<0.001).干扰C10orf10的表达后,在常氧和低氧环境下均能够显著抑制胶质瘤细胞的生长(均P<0.05).结论:C10orf10的表达水平与胶质瘤的生长和预后相关,并有望成为胶质瘤的一个预后标志物及治疗靶点. |
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| ISSN: | 1672-7347 |
| DOI: | 10.11817/j.issn.1672-7347.2023.220396 |