大豆籽粒Ve含量的全基因组关联分析

维生素E(Ve)是大豆油中一种天然抗氧化剂,是评价大豆油营养价值的重要指标.本研究利用含有 264 份的大豆自然群体在2021年和2022年测定了籽粒中α-、γ-和δ-生育酚含量,并进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS).本研究共检测到 199 个与大豆Ve含量显著关联的SNP位点,其中 9 个可在 2 个环境或者 2 个性状被重复检测到,分别位于 3 号、7 号、11 号、12 号、13 号、15 号、17 号和 18 号染色体上.其中位于 7 号染色体上的显著关联信号是控制α-生育酚含量的主效位点,可在 2 年环境中被检测到,表型变异解...

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Published in作物学报 Vol. 50; no. 5; pp. 1223 - 1235
Main Authors 张红梅, 张威, 王琼, 贾倩茹, 孟珊, 熊雅文, 刘晓庆, 陈新, 陈华涛
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 南京农业大学生命科学学院, 江苏南京 210095 2024
江苏省农业科学院经济作物研究所, 江苏南京 210014%江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所, 江苏南京 210014%南京农业大学生命科学学院, 江苏南京 210095%江苏省农业科学院经济作物研究所, 江苏南京 210014
Subjects
Ve含量
soybean
Ve content
GWAS
candidate gene
大豆
seed
候选基因
全基因组关联分析
籽粒
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ISSN0496-3490
DOI10.3724/SP.J.1006.2024.34202

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Summary:维生素E(Ve)是大豆油中一种天然抗氧化剂,是评价大豆油营养价值的重要指标.本研究利用含有 264 份的大豆自然群体在2021年和2022年测定了籽粒中α-、γ-和δ-生育酚含量,并进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS).本研究共检测到 199 个与大豆Ve含量显著关联的SNP位点,其中 9 个可在 2 个环境或者 2 个性状被重复检测到,分别位于 3 号、7 号、11 号、12 号、13 号、15 号、17 号和 18 号染色体上.其中位于 7 号染色体上的显著关联信号是控制α-生育酚含量的主效位点,可在 2 年环境中被检测到,表型变异解释率为 9.83%.对该位点候选基因进行筛选,获得一个编码myb转录因子的基因Glyma.07G054000,可能是这个位点的效应基因.另外,在 12 号染色体上得到 2 个编码γ-生育酚甲基转移酶的基因Glyma.12G014200 和Glyma.12G014300,有可能是影响Ve含量的重要基因.本研究结果有助于解析大豆籽粒Ve含量的遗传基础及其调控机制,为大豆品质遗传改良奠定了基础.
ISSN:0496-3490
DOI:10.3724/SP.J.1006.2024.34202