大白猪多群体一步法基因组选择的应用效果分析

• Published in: 广东农业科学 Vol. 50; no. 11; pp. 113 - 122
• Main Authors: 卢宇金, 黄珍, 许华钊, 石少磊, 周洁, 张哲, 谢水华
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广东省农业技术推广中心,广东 广州 510520 2023; 华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510642%广东艾佩克科技有限公司,广东 广州 510470%广东省农业技术推广中心,广东 广州 510520%华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510642
• Subjects: genomic selection; connectedness rating; 一步法GBLUP(ssGBLUP); 大白猪; growth trait; heritability; 基因组选择; 遗传力; 生长性状; 场间关联率; Yorkshire; 合并群体; single-step GBLUP(ssGLUP); combined populations
• ISSN: 1004-874X
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2023.11.011

S114%S813.1; [目的]探究在拥有大量无基因型参考群的群体中,基因组选择(GS)方法与传统BLUP方法预测准确性的差异.同时,对比联合评估中GBLUP和一步法GBLUP的应用效果,为联合评估提供参考依据.[方法]使用 6 个大白猪群体(A～F)的校正达 100 kg体重日龄(DAYS_100)和校正达 100 kg体重背膘厚(BFT_100)2个性状进行分析,并估计遗传力及遗传相关.探究BLUP、GBLUP和ssGBLUP模型在不同群体及合并群体中的预测准确性.[结果](1)F群体BFT_100性状遗传力较低、仅为0.071,其他群体的BFT_100性状遗传力为0.205～0.383.6个群体的DAYS_100性状遗传力为0.258～0.598.(2)除D群体2个性状间的遗传相关为0.211外,其他群体的遗传相关为负相关(-0.462～-0.200).(3)对于DAYS_100 性状,B、C、E和F群体中GBLUP模型的预测准确性最高.对于BFT_100 性状,A、B和C群体中ssGBLUP模型的预测准确性最高,而D和E群体中GBLUP模型的预测准确性最高.(4)F群体与A群体的场间关联率(CR)达 3.096%,而在F群体中,使用合并参考群的一步法基因组选择,可以提高BFT_100 性状的预测准确性.[结论]在基因型个体数>500 且群体占比＞7%的群体中,GBLUP或ssGBLUP模型的预测准确性高于BLUP模型;利用ssGBLUP模型对场间关联率达到 3%的群体进行联合评估,可提高低遗传力性状的预测准确性.