黄姑鱼(Nibea albiflora)肌肉脂肪酸组成的全基因组关联分析

Q955%Q789%S965.325; 黄姑鱼是我国重要的海水经济鱼类,随着养殖规模逐渐扩大,对其优良养殖种质的需求也愈加迫切.不饱和脂肪酸含量作为重要的营养品质性状,受到育种研究学者的广泛关注.测定了 179尾黄姑鱼选育群体后代的肌肉脂肪酸组成,获得了以n-3长链多不饱和脂肪酸相对含量等表型性状,对这179尾个体开展全基因组重测序,经过质控、变异检测后获得2 940 251个高质量单核苷酸多态性(SNP)位点;基于混合线性模型对脂肪酸表型开展全基因组关联分析,定位到19个显著相关的SNP位点,并鉴别到27个候选基因,其中编码Mth938结构域包含蛋白的基因(aamdc)被认为是参与调控脂肪生...

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Published in海洋与湖沼 Vol. 55; no. 6; pp. 1532 - 1540
Main Authors 竺奇慧, 金鲟, 刘炳舰, 张万昌, 李完波, 杨建, 徐冬冬
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 浙江万里学院海洋生物种业研究院 浙江宁波 315100 01.11.2024
浙江省海洋水产研究所 浙江海洋大学海洋与渔业研究所 浙江省海水增养殖重点实验室 浙江舟山 316021%浙江海洋大学海洋科学与技术学院 海洋生物种质资源发掘利用国家地方联合工程实验室 浙江舟山 316022%南昌大学生命科学学院 江西南昌 330038%集美大学水产学院 福建厦门 361021%浙江万里学院海洋生物种业研究院 浙江宁波 315100%浙江省海洋水产研究所 浙江海洋大学海洋与渔业研究所 浙江省海水增养殖重点实验室 浙江舟山 316021
Subjects
黄姑鱼
重测序
fatty acid composition
全基因组关联分析
Nibea albiflora
re-sequencing
whole genome association analysis
脂肪酸组成
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ISSN0029-814X
DOI10.11693/hyhz20240700153

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Summary:Q955%Q789%S965.325; 黄姑鱼是我国重要的海水经济鱼类,随着养殖规模逐渐扩大,对其优良养殖种质的需求也愈加迫切.不饱和脂肪酸含量作为重要的营养品质性状,受到育种研究学者的广泛关注.测定了 179尾黄姑鱼选育群体后代的肌肉脂肪酸组成,获得了以n-3长链多不饱和脂肪酸相对含量等表型性状,对这179尾个体开展全基因组重测序,经过质控、变异检测后获得2 940 251个高质量单核苷酸多态性(SNP)位点;基于混合线性模型对脂肪酸表型开展全基因组关联分析,定位到19个显著相关的SNP位点,并鉴别到27个候选基因,其中编码Mth938结构域包含蛋白的基因(aamdc)被认为是参与调控脂肪生成过程,可能是后续研究黄姑鱼肌肉脂肪酸组成以及进行相关选育研究的重要标记基因.研究结果为解析鱼类肌肉脂肪酸组成的遗传机制研究提供了参考依据,同时也为黄姑鱼优良新品种培育提供了理论指导.
ISSN:0029-814X
DOI:10.11693/hyhz20240700153