宏基因组二代测序在异基因造血干细胞移植后耶氏肺孢子菌肺炎诊断中的意义

• Published in: 中华血液学杂志 Vol. 45; no. 1; pp. 62 - 67
• Main Authors: 符蓉, 林韧, 范志平, 黄芬, 许娜, 宣丽, 黄怡霏, 刘慧, 赵珂, 王治香, 蒋玲, 戴敏, 孙竞, 刘启发
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 南方医科大学南方医院血液科，南方医科大学血液病研究所，广东省血液系统疾病临床医学研究中心，广州 510515 14.01.2024
• Subjects: 耶氏肺孢子菌肺炎; Metagenomic next-generation sequencing; 异基因造血干细胞移植; Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation; Pneumocystis jirovecii pneumonia; 宏基因组二代测序
• ISSN: 0253-2727
• DOI: 10.3760/cma.j.cn121090-20230928-00147

目的:评估宏基因组二代测序（mNGS）对异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）患者耶氏肺孢子菌肺炎（PJP）的诊断价值。方法:纳入2019年6月至2023年8月南方医科大学南方医院血液科allo-HSCT后疑似肺感染并接受肺泡灌洗液病原学检测的98例患者，比较mNGS与常规方法、实时定量PCR（RQ-PCR）对PJP的诊断效能。结果:12例患者最终诊断为PJP（确诊11例、临床诊断1例）。确诊患者中1例为常规方法和RQ-PCR检测均阳性，10例仅RQ-PCR阳性。12例患者mNGS均检出耶氏肺孢子菌。mNGS诊断PJP的敏感性为100%，高于常规方法（8.3%， P＝0.001），与RQ-PCR（91.6%）相当（ P＝1.000）。75%的PJP患者为肺混合感染，合并EB病毒和巨细胞病毒最为常见。mNGS检出混合感染8例，RQ-PCR检出5例，常规方法未检出（ P＝0.008）。 结论:mNGS在allo-HSCT患者PJP诊断中具有良好的敏感性，在混合感染病原检测方面具有优势，可作为常规检测方法及RQ-PCR的有效补充。