马氏珠母贝TNFR27基因克隆与功能初探

Q785%S968.3; 为了探究肿瘤坏死因子受体(tumor necrosis factor receptor,TNFR)基因在马氏珠母贝中的免疫应答机制,本实验采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了马氏珠母贝TNFR27(PmTNFR27)基因cDNA全长并进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了马氏珠母贝在脂多糖(LPS)、聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]及镉胁迫后,PmTNFR27 mRNA在其不同组织中的表达模式.结果显示,PmTNFR27 cDNA全长为1 524 bp,5'UTR长为186 bp,3'UTR长为248 bp...

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Published in水产学报 Vol. 48; no. 6; pp. 13 - 23
Main Authors 梁碧丹, 卢金昭, 梁海鹰, 张美珍, 申铖皓, 张彬
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室,广东湛江 524088 2024
广东海洋大学水产学院,广东湛江 524088%广东海洋大学水产学院,广东湛江 524088
Subjects
PmTNFR27
gene cloning
马氏珠母贝
immune stimulation
Pinctada fucata martensii
免疫刺激
基因克隆
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ISSN1000-0615
DOI10.11964/jfc.20220413450

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Summary:Q785%S968.3; 为了探究肿瘤坏死因子受体(tumor necrosis factor receptor,TNFR)基因在马氏珠母贝中的免疫应答机制,本实验采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了马氏珠母贝TNFR27(PmTNFR27)基因cDNA全长并进行生物信息学分析,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了马氏珠母贝在脂多糖(LPS)、聚肌胞苷酸[Poly(I∶C)]及镉胁迫后,PmTNFR27 mRNA在其不同组织中的表达模式.结果显示,PmTNFR27 cDNA全长为1 524 bp,5'UTR长为186 bp,3'UTR长为248 bp,包含28bp的poly(A)尾巴,开放阅读框(ORF)为1 062 bp,编码353个氨基酸;结构域预测表明PmTNFR27具有一个典型的CRD结构域和一个跨膜蛋白结构域,符合肿瘤坏死因子受体超家族特征;多序列比对结果显示,贝类种间的相似性不高,但功能结构域位置较保守.系统进化树结果显示,马氏珠母贝与其他贝类聚为一支.qRT-PCR结果显示,PmTNFR27mRNA在马氏珠母贝各组织中均有表达,在鳃中相对表达量最高.LPS刺激后,PmTNFR27基因在鳃中的相对表达量于3 h显著上升并达到最高值,于72h降到最低值,最高值约为最低值的9.67倍;Poly(I∶C)刺激后,PmTNFR27基因在鳃中的相对表达量在6、12 h显著上升并达到最高值,至96h时降到最低值,最高值约为最低值的13.16倍.镉胁迫后,3h相对表达量达到最高,24、48 h相对表达量显著下降.研究表明,PmTNFR27可能参与了马氏珠母贝的免疫应答反应.本研究可为进一步探究TNFR在贝类中的生物学功能提供重要的理论基础和参考价值.
ISSN:1000-0615
DOI:10.11964/jfc.20220413450