普通烟草ALMT基因家族的鉴定与表达分析

TS414; 为了挖掘可能参与烟草氯离子吸收转运的铝激活苹果酸转运蛋白(Al-activated malate transporter,ALMT)基因家族成员,利用生物信息学方法,系统地分析了烟草ALMT基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构和保守结构域等;利用qPCR的方法分析了烟草ALMT基因在不同组织中的表达情况,以及在盐(NaCl)处理下的表达特征.结果表明:普通栽培烟草基因组中鉴定出30个可能的ALMT家族基因,根据系统发育树可将其划分为五个亚组;NtALMT基因的基因结构和motif分布与其他物种一致,具有高度保守的WEP motif;组织表达特异性分析结果发现...

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Published in烟草科技 Vol. 53; no. 5; pp. 1 - 9
Main Authors 张慧, 李泽锋, 徐国云, 金静静, 王晨, 翟妞, 金立锋, 郑庆霞, 陈千思, 刘萍萍, 周会娜
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国烟草总公司郑州烟草研究院,郑州高新技术产业开发区枫杨街2号,450001 01.05.2020
Subjects
氯盐胁迫
ALMT基因家族
烟草
表达分析
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ISSN1002-0861
DOI10.16135/j.issn1002-0861.2019.0079

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Summary:TS414; 为了挖掘可能参与烟草氯离子吸收转运的铝激活苹果酸转运蛋白(Al-activated malate transporter,ALMT)基因家族成员,利用生物信息学方法,系统地分析了烟草ALMT基因家族成员的蛋白理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构和保守结构域等;利用qPCR的方法分析了烟草ALMT基因在不同组织中的表达情况,以及在盐(NaCl)处理下的表达特征.结果表明:普通栽培烟草基因组中鉴定出30个可能的ALMT家族基因,根据系统发育树可将其划分为五个亚组;NtALMT基因的基因结构和motif分布与其他物种一致,具有高度保守的WEP motif;组织表达特异性分析结果发现大多数NtALMT基因在茎中表达较高,只有NtALMT28在叶中表达量最高;氯盐处理下,茎中NtALMT10表达量升高8倍以上,叶中NtALMT19表达量升高25倍以上,暗示了这些基因可能与烟草氯离子吸收转运相关.
ISSN:1002-0861
DOI:10.16135/j.issn1002-0861.2019.0079