메타전사체 분석을 이용한 국내 대추나무의 바이러스 감염실태

This work investigated the viral infection in jujube plants in Korea. A total of 61 samples with the symptoms of putative viral infection were collected from experimental fields and orchards. Thereafter, the samples were subjected to metatranscriptome analysis, Reverse transcription polymerase chain...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published inSigmulbyeong yeon'gu Vol. 29; no. 3; pp. 276 - 285
Main Authors 이홍규(Hong-Kyu Lee), 한승주(Seongju Han), 박상민(Sangmin Bak), 김민석(Minseok Kim), 민진경(Jean Geung Min), 김학주(Hak ju Kim), 강동현(Dong Hyun Kang), 김민희(Minhui Kim), 정원영(Wonyoung Jeong), 백승빈(Seungbin Baek), 양민주(Minjoo Yang), 임태건(Taegun Lim), 안찬훈(Chanhoon An), 김태동(Tae-Dong Kim), 박충열(Chung Youl Park), 문제선(Jae Sun Moon), 이수헌(Su-Heon Lee)
Format Journal Article
LanguageKorean
Published 한국식물병리학회 01.09.2023
Subjects
Online AccessGet full text
ISSN1598-2262
2233-9191
DOI10.5423/RPD.2023.29.3.276

Cover

More Information
Summary:This work investigated the viral infection in jujube plants in Korea. A total of 61 samples with the symptoms of putative viral infection were collected from experimental fields and orchards. Thereafter, the samples were subjected to metatranscriptome analysis, Reverse transcription polymerase chain reaction analysis, and nucleotide sequence analysis. These analyses identified the presence of two DNA viruses, jujube-associated badnavirus (JuBV), jujube mosaic-associated virus (JuMaV), and one RNA virus, jujube yellow mottle-associated virus (JYMaV). All samples collected were confirmed to be infected by at least one of the three viruses, with most showed multiple infections. The detection rates of JuBV, JYMaV, and JuMaV were 100%, 90.2%, and 8.2%, respectively. Only three combinations of viral infections were found: 9.8% of samples showed single infection of JuBV, 82.0% showed double infection of JuBV+JYMaV, and 8.2% showed triple infection of JuBV+JYMaV+JuMaV. Sequence analysis of the three viruses showed very high homology with respective virus isolates reported in China. This study is predicted to provide fundamental data to produce virus-free jujube seedlings and represents the first report of JuBV and JuMaV infection in Korea. 본 연구는 국내 대추나무 바이러스 감염실태를 구명하기 위하여 시험포장 및 농가포장에서 다양한 이상증상을 나타내는 시료 61점을 채집하였다. 이후 채집한 시료는 메타전사체 분석, reverse transcription polymerase chain reac tion 진단, 염기서열 분석에 사용하였다. 그 결과 국내 대추나무에서는 2종의 DNA 바이러스, jujube associated badnavirus (JuBV), jujube mosaic-associated virus (JuMaV)와 1종의 RNA 바이러스, jujube yellow mottle-associated virus (JYMaV)를 동정하였다. 채집된 모든 시료는 3종 바이러스에 단독 또는 복합감염되어 있음을 확인하였다. 바이러스별 검출은 JuBV 100%, JYMaV 90.2%, JuMaV 8.2%로 나타났다. 3종 바이러스의 감염조합은 JuBV 단독감염 9.8%, JuBV+JYMaV 2종 복합감염 82.0%, JuBV+JYMaV+JuMaV 3종 복합감염 8.2%로 나타났다. 국내 대추나무에서 검출된 3종 바이러스의 염기서열 분석결과 중국에서 보고된 각각의 바이러스 분리주와 매우 높은 상동성을 나타내었다. 본 논문은 대추나무 바이러스 무병묘 생산을 위한 기초자료로 활용될 수 있을 것으로 기대되며, 국내 대추나무에서 바이러스 감염실태와 JuBV와 JuMaV에 대한 첫 보고이다.
Bibliography:KISTI1.1003/JNL.JAKO202328943213866
https://doi.org/10.5423/RPD.2023.29.3.276
ISSN:1598-2262
2233-9191
DOI:10.5423/RPD.2023.29.3.276