質量分析計による蛋白質同定～シグナル伝達研究への応用

「和文抄録」質量分析計による蛋白質同定は, 相互作用解析やリン酸化部位の決定など, シグナル伝達研究の有力なツールとなるが, サンプルが微量のため, 同定が困難な事が多い. 当研究室では, 微量な蛋白質を質量分析で同定するためのサンプル調製法を独自に開発し, 従来のゲル内消化では困難だった微量な蛋白質を質量分析計で同定する事に成功したので, その方法と実施例について, 紹介する. 「はじめに」質量分析計による蛋白質同定は, 蛋白質の網羅的な同定といった大規模解析の他, シグナル伝達研究の有力なツールとなる. 例えば, 免疫沈降やプルダウンアッセイ等の相互作用解析で, ある蛋白質と結合する蛋白質...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in山口医学 Vol. 64; no. 3; pp. 177 - 181
Main Authors 張, 影, 小林, 誠, 岸, 博子
Format Journal Article
LanguageJapanese
Published 山口大学医学会 01.08.2015
Subjects
シグナル伝達研究
蛋白質同定
質量分析
Online AccessGet full text
ISSN0513-1731
1880-4462
DOI10.2342/ymj.64.177

Cover

Abstract 「和文抄録」質量分析計による蛋白質同定は, 相互作用解析やリン酸化部位の決定など, シグナル伝達研究の有力なツールとなるが, サンプルが微量のため, 同定が困難な事が多い. 当研究室では, 微量な蛋白質を質量分析で同定するためのサンプル調製法を独自に開発し, 従来のゲル内消化では困難だった微量な蛋白質を質量分析計で同定する事に成功したので, その方法と実施例について, 紹介する. 「はじめに」質量分析計による蛋白質同定は, 蛋白質の網羅的な同定といった大規模解析の他, シグナル伝達研究の有力なツールとなる. 例えば, 免疫沈降やプルダウンアッセイ等の相互作用解析で, ある蛋白質と結合する蛋白質を検出した場合, ウェスタンブロットでは, どの様な蛋白質が結合しているか予測し, それに対する抗体を選択しなければならないが, 質量分析は, 全く情報の無い状態で, あるいは, 良い抗体が入手できない状態でも, 蛋白質を同定する事ができる.
AbstractList 質量分析計による蛋白質同定は，相互作用解析やリン酸化部位の決定など，シグナル伝達研究の有力なツールとなるが，サンプルが微量のため，同定が困難な事が多い．当研究室では，微量な蛋白質を質量分析で同定するためのサンプル調製法を独自に開発し，従来のゲル内消化では困難だった微量な蛋白質を質量分析計で同定する事に成功したので，その方法と実施例について，紹介する．
「和文抄録」質量分析計による蛋白質同定は, 相互作用解析やリン酸化部位の決定など, シグナル伝達研究の有力なツールとなるが, サンプルが微量のため, 同定が困難な事が多い. 当研究室では, 微量な蛋白質を質量分析で同定するためのサンプル調製法を独自に開発し, 従来のゲル内消化では困難だった微量な蛋白質を質量分析計で同定する事に成功したので, その方法と実施例について, 紹介する. 「はじめに」質量分析計による蛋白質同定は, 蛋白質の網羅的な同定といった大規模解析の他, シグナル伝達研究の有力なツールとなる. 例えば, 免疫沈降やプルダウンアッセイ等の相互作用解析で, ある蛋白質と結合する蛋白質を検出した場合, ウェスタンブロットでは, どの様な蛋白質が結合しているか予測し, それに対する抗体を選択しなければならないが, 質量分析は, 全く情報の無い状態で, あるいは, 良い抗体が入手できない状態でも, 蛋白質を同定する事ができる.
Author 岸, 博子
張, 影
小林, 誠
Author_xml – sequence: 1
  fullname: 張, 影
  organization: 山口大学大学院医学系研究科生体機能分子制御学分野（生理学第一）
– sequence: 1
  fullname: 小林, 誠
  organization: 山口大学大学院医学系研究科生体機能分子制御学分野（生理学第一）
– sequence: 1
  fullname: 岸, 博子
  organization: 山口大学大学院医学系研究科生体機能分子制御学分野（生理学第一）
BookMark eNo1kE9LAkEYxocoSK1L32NtZufdndlDh5CyIOpS52GaHW0XXWOtg0cNSirIg5f-SUcriCCoDkkfZjL11Fdoxbo8D7wPz--FJ42mo0qkEVogOGtTsBdr5TDrQpYwNoVShHNsAbj2NEphh1CLMEpmUbpaDTEGwilJoc3hy8Po5KLfPP7utIbdpqk_mkbTNM6G12eDy16S9lvn_aern17HNN5M49kcnZqjx6-P21G9PbhrD-5fTf3d1J_6nzeDdncOzRRkqarn_zyDdlZXtnNr1sZWfj23vGGFlGPP4i7ztasK3q7vgaYeB7cABcJ8ZYPNlXIkYOCOVJ5PeJL6hDgM-0AV08CwphmUn3DL2g-ULFWiUhBpEVYO4yj5K3zp1MpFFQgbE0dg7AKmidkCJ9MkwokNnssIJKSlCSmsHsiiFvtxUJZxTcj4IFAlLZJFhQuCjmXc_b-rPRmLUNJf9O6LUA
ContentType Journal Article
Copyright 2015 山口大学医学会
Copyright_xml – notice: 2015 山口大学医学会
CorporateAuthor 山口大学大学院医学系研究科生体機能分子制御学分野(生理学第一
CorporateAuthor_xml – name: 山口大学大学院医学系研究科生体機能分子制御学分野(生理学第一
DOI 10.2342/ymj.64.177
DatabaseTitleList

DeliveryMethod fulltext_linktorsrc
Discipline Medicine
EISSN 1880-4462
EndPage 181
ExternalDocumentID da5ymgci_2015_006403_002_0177_01812496714
article_ymj_64_3_64_177_article_char_ja
GroupedDBID 123
2WC
53G
ABJNI
ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS
CS3
JSF
KQ8
MOJWN
OK1
RJT
ID FETCH-LOGICAL-j3809-867de6cf9bd94e39846f4f17dc2428cc5a40485ac9d18984d11570d43c7e470e3
ISSN 0513-1731
IngestDate Thu Jul 10 16:14:56 EDT 2025
Wed Sep 03 06:30:23 EDT 2025
IsDoiOpenAccess true
IsOpenAccess true
IsPeerReviewed true
IsScholarly true
Issue 3
Language Japanese
LinkModel OpenURL
MergedId FETCHMERGED-LOGICAL-j3809-867de6cf9bd94e39846f4f17dc2428cc5a40485ac9d18984d11570d43c7e470e3
OpenAccessLink https://www.jstage.jst.go.jp/article/ymj/64/3/64_177/_article/-char/ja
PageCount 5
ParticipantIDs medicalonline_journals_da5ymgci_2015_006403_002_0177_01812496714
jstage_primary_article_ymj_64_3_64_177_article_char_ja
PublicationCentury 2000
PublicationDate 2015-08-01
PublicationDateYYYYMMDD 2015-08-01
PublicationDate_xml – month: 08
  year: 2015
  text: 2015-08-01
  day: 01
PublicationDecade 2010
PublicationTitle 山口医学
PublicationTitleAlternate 山口医学
PublicationYear 2015
Publisher 山口大学医学会
Publisher_xml – name: 山口大学医学会
References 3 Shirao S, Kashiwagi S, Sato M, Miwa S, Nakao F, Kurokawa T, Todoroki-Ikeda N, Mogami K, Mizukami Y, Kuriyama S, Haze K, Suzuki M, Kobayashi S. Sphingosylphosphorylcholine is a novel messenger for rho-kinase-mediated Ca2+ sensitization in the bovine cerebral artery unimportant role for protein kinase C. Circ Res 2002；91：112-119.
1 岡村信子，篠原あづさ，岩松明彦．MALDl－TOF/MS分析のためのペプチド断片調製法．実験医学　2002；20：2367-2370.
4 Nakao F, Kobayashi S, Mogami K, Mizukami Y, Shirao S, Miwa S, Todoroki-Ikeda N, Ito M, Matsuzaki M. Involvement of Src family protein tyrosine kinases in Ca2+ sensitization of coronary artery contraction mediated by a sphingosylphosphorylcholine-Rho-kinase pathway. Circ Res 2002；91：953-960.
2 Todoroki-Ikeda N, Mizukami Y, Mogami K, Kusuda T, Yamamoto K, Miyake T, Sato M, Suzuki S, Yamagata H, Hokazono Y, Kobayashi S. Sphingosylphosphorylcholine induces Ca2+-sensitization of vascular smooth muscle contraction： Possible involvement of Rho-kinase. FEBS Lett 2000；482：85-90.
5 Walsh T, Walsh V, Vreugde S, Hertzano R, Shahin H, Haika S, Lee M K, Kanaan M, King M.-C, Avraham K B. From flies’eyes to our ears：mutations in a human class III myosin cause progressive nonsyndromic hearing loss DFNB30. Proc Natl Acad Sci U S A 2002；99：7518-7523.
6 An B C, Sakai T, Komaba S, Kishi H, Kobayashi S, Kim J Y, Ikebe R, Ikebe M. Phosphorylation of the Kinase Domain Regulates Autophosphorylation of Myosin IIIA and Its Translocation in Microvilli. Biochemistry 2014；53：7835-7845.
References_xml – reference: 4 Nakao F, Kobayashi S, Mogami K, Mizukami Y, Shirao S, Miwa S, Todoroki-Ikeda N, Ito M, Matsuzaki M. Involvement of Src family protein tyrosine kinases in Ca2+ sensitization of coronary artery contraction mediated by a sphingosylphosphorylcholine-Rho-kinase pathway. Circ Res 2002；91：953-960.
– reference: 5 Walsh T, Walsh V, Vreugde S, Hertzano R, Shahin H, Haika S, Lee M K, Kanaan M, King M.-C, Avraham K B. From flies’eyes to our ears：mutations in a human class III myosin cause progressive nonsyndromic hearing loss DFNB30. Proc Natl Acad Sci U S A 2002；99：7518-7523.
– reference: 6 An B C, Sakai T, Komaba S, Kishi H, Kobayashi S, Kim J Y, Ikebe R, Ikebe M. Phosphorylation of the Kinase Domain Regulates Autophosphorylation of Myosin IIIA and Its Translocation in Microvilli. Biochemistry 2014；53：7835-7845.
– reference: 2 Todoroki-Ikeda N, Mizukami Y, Mogami K, Kusuda T, Yamamoto K, Miyake T, Sato M, Suzuki S, Yamagata H, Hokazono Y, Kobayashi S. Sphingosylphosphorylcholine induces Ca2+-sensitization of vascular smooth muscle contraction： Possible involvement of Rho-kinase. FEBS Lett 2000；482：85-90.
– reference: 1 岡村信子，篠原あづさ，岩松明彦．MALDl－TOF/MS分析のためのペプチド断片調製法．実験医学　2002；20：2367-2370.
– reference: 3 Shirao S, Kashiwagi S, Sato M, Miwa S, Nakao F, Kurokawa T, Todoroki-Ikeda N, Mogami K, Mizukami Y, Kuriyama S, Haze K, Suzuki M, Kobayashi S. Sphingosylphosphorylcholine is a novel messenger for rho-kinase-mediated Ca2+ sensitization in the bovine cerebral artery unimportant role for protein kinase C. Circ Res 2002；91：112-119.
SSID ssj0041831
ssib005880118
ssib000871986
ssib002484434
ssib002224191
ssib002220378
ssib005901909
Score 2.0306575
Snippet ...
「和文抄録」質量分析計による蛋白質同定は, 相互作用解析やリン酸化部位の決定など, シグナル伝達研究の有力なツールとなるが, サンプルが微量のため, 同定が困難な事が多い. 当研究室では, 微量な蛋白質を質量分析で同定するためのサンプル調製法を独自に開発し,...
SourceID medicalonline
jstage
SourceType Publisher
StartPage 177
SubjectTerms シグナル伝達研究
蛋白質同定
質量分析
Title 質量分析計による蛋白質同定～シグナル伝達研究への応用
URI https://www.jstage.jst.go.jp/article/ymj/64/3/64_177/_article/-char/ja
http://mol.medicalonline.jp/en/journal/download?GoodsID=da5ymgci/2015/006403/002&name=0177-0181j
Volume 64
hasFullText 1
inHoldings 1
isFullTextHit
isPrint
ispartofPNX 山口医学, 2015/08/01, Vol.64(3), pp.177-181
link http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwnV3Na9RAFA-1gggifmL9ogfnuDXJzCQzN5PdLEVoQWiht7D5WHFhq2h7qLfdghYr2EMvfhWP1UIRBPVg8Y-J67Yn_wXfm0m2We2hLYTs25nJzJs3k7zfJDO_MYxbXKaxiLgLyE1EFRY3k4psgkTTpsNjKhpRgq8GpqadyVl2d47PjZxol2YtLS5EE_HTA9eVHKdVIQzaFVfJHqFlB5lCAMjQvnCGFobzodqYBIL4lHgeCSSBUb2ok4ATIYhwSOAQGRBpYhpPYGBAATYSz1eCXYSA4GMa6SvBJVISv1bKmWMmooqCBxlCSB0TQOb6ct8tBFMJcHi5gGUx4leJrCkNLSIZFuGZhQBlObli_kDDAMvy60RWlT4M9C9jaBVr4YGVrROPKqFKfF8pWSPe4HWjSgsxHLuS-lODC4diTWU2bS1XJxNYcc8cSmajgnkmoqbsoMrS25AWL04sPpi2p7v6wcp6UCd3oOz_6hdm80rPaW4hy2vuzFLtR-CxWIGR9pCj0XTt-Q1FS17Dyney0QDE0nvY_OvbbMqQK3ep3Zpw2MTgkiGu8LwnhpAodFhI8YRk7kU4ruQLWzCcOGm7ADVxDsO9Mhp3LSnK7Hm2SUtsbzbCPVleBi1YmV2QQ6WtEtTBZc0S2eE0MGLgPdQGloW9NFsw1uv2fq0ACbZgXISEF2fa-lul5owpwb6Zc8bZfLw27umqnTdGWo0LxqmpfEbKRWN698unveeveivPfm-s7W6uZJ2trLuSdVd33672X-9AbG_tZW_7zZ-djaz7Let-zpZfZMtbv3683-us9z-s9z9-zTrfs8527-e7_vrmJWO2HsxUJyv5HiWVFhWmrAjHTVInbsookSylEuB8kzUtN4kB-4o45g0GPpI3YplYAmITJLcyE0ZjN2WumdLLxuj8w_n0ijEOBpJmJJvId8WshIGvTTh1zFRGYK0oHTMcbZnwkSaiCQ_Z3GPGnSFLhvkj7EmYNPhS-378IMT7I1Rf9Sn82KGptgBQ6F86rsWuHrfsa8bp_XvvujG68HgxvQEwfiG6qTrfX4kQzQU
linkProvider Colorado Alliance of Research Libraries
openUrl ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E8%B3%AA%E9%87%8F%E5%88%86%E6%9E%90%E8%A8%88%E3%81%AB%E3%82%88%E3%82%8B%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B3%AA%E5%90%8C%E5%AE%9A%EF%BD%9E%E3%82%B7%E3%82%B0%E3%83%8A%E3%83%AB%E4%BC%9D%E9%81%94%E7%A0%94%E7%A9%B6%E3%81%B8%E3%81%AE%E5%BF%9C%E7%94%A8&rft.jtitle=%E5%B1%B1%E5%8F%A3%E5%8C%BB%E5%AD%A6&rft.au=%E5%BC%B5%2C+%E5%BD%B1&rft.au=%E5%B0%8F%E6%9E%97%2C+%E8%AA%A0&rft.au=%E5%B2%B8%2C+%E5%8D%9A%E5%AD%90&rft.date=2015-08-01&rft.pub=%E5%B1%B1%E5%8F%A3%E5%A4%A7%E5%AD%A6%E5%8C%BB%E5%AD%A6%E4%BC%9A&rft.issn=0513-1731&rft.eissn=1880-4462&rft.volume=64&rft.issue=3&rft.spage=177&rft.epage=181&rft_id=info:doi/10.2342%2Fymj.64.177&rft.externalDocID=article_ymj_64_3_64_177_article_char_ja
thumbnail_l http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/lc.gif&issn=0513-1731&client=summon
thumbnail_m http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/mc.gif&issn=0513-1731&client=summon
thumbnail_s http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/sc.gif&issn=0513-1731&client=summon