環境DNAを用いた感染症研究への期待

環境中のDNA情報から微生物だけでなくマクロ生物の生態を読み解こうとする「環境DNA分析」と呼ばれる技術が急速に発展している．環境DNAとは水や土などの環境媒体に含まれるDNAの総称であり，生物体そのものに含まれるDNAや，糞や体表粘液などを介して放出されたマクロ生物の生体外DNAを含む．環境DNAの分析には大きく分けて，種特異的検出とメタバーコーディングの2種類の手法があり，目的によって使い分けられる．適用可能な対象は微生物から脊椎動物まで，遺伝子としてDNAをもつあらゆる生物（ここではウイルスを含む）であり，川や池などの陸水域だけでなく海域への適用も報告されている．本稿ではマクロ生物の環境...

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Published inUirusu Vol. 66; no. 2; pp. 171 - 178
Main Author 源, 利文
Format Journal Article
LanguageJapanese
Published Tokyo 日本ウイルス学会 01.01.2016
Japan Science and Technology Agency
Subjects
Deoxyribonucleic acid
DNA
Environmental DNA
Infectious diseases
Lakes
Organisms
Rivers
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ISSN0042-6857
1884-3433
DOI10.2222/jsv.66.171

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Summary:環境中のDNA情報から微生物だけでなくマクロ生物の生態を読み解こうとする「環境DNA分析」と呼ばれる技術が急速に発展している．環境DNAとは水や土などの環境媒体に含まれるDNAの総称であり，生物体そのものに含まれるDNAや，糞や体表粘液などを介して放出されたマクロ生物の生体外DNAを含む．環境DNAの分析には大きく分けて，種特異的検出とメタバーコーディングの2種類の手法があり，目的によって使い分けられる．適用可能な対象は微生物から脊椎動物まで，遺伝子としてDNAをもつあらゆる生物（ここではウイルスを含む）であり，川や池などの陸水域だけでなく海域への適用も報告されている．本稿ではマクロ生物の環境DNA分析の現状を紹介するとともに，ウイルス学をはじめとする感染症の研究分野への応用可能性，およびそのために解決すべき課題について述べる．
Bibliography:ObjectType-Article-1
SourceType-Scholarly Journals-1
ObjectType-Feature-2
content type line 14
ISSN:0042-6857
1884-3433
DOI:10.2222/jsv.66.171