つつが虫病患者由来の Karp 型 Orientia tsutsugamushi 56-kDa タンパク遺伝子シークエンスによる亜型分類
山形県，新潟県及び秋田県で発生した Karp 型感染によるつつが虫病患者由来 Orientia tsutsugamushi 遺伝子の亜型分類を行った．30 人の患者血液から抽出された DNA を試料とし，nested-PCR で得られた O. tsutsugamushi の 56-kDa タンパク遺伝子のダイレクトシークエンスを行い，その解析を行った．30 例を解析した結果 27 例と 3 例の 2 つのグループに分類された．データベース株と比較したところ 27 例のグループはJ P-1 型に分類されるyeo-joo 株と，3 例のグループは JP-2 型に分類される CMM1，KNP1 及び...
Saved in:
| Published in | 感染症学雑誌 Vol. 85; no. 6; pp. 626 - 631 |
|---|---|
| Main Authors | , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Japanese |
| Published |
一般社団法人 日本感染症学会
20.11.2011
|
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 0387-5911 1884-569X |
| DOI | 10.11150/kansenshogakuzasshi.85.626 |
Cover
| Abstract | 山形県，新潟県及び秋田県で発生した Karp 型感染によるつつが虫病患者由来 Orientia tsutsugamushi 遺伝子の亜型分類を行った．30 人の患者血液から抽出された DNA を試料とし，nested-PCR で得られた O. tsutsugamushi の 56-kDa タンパク遺伝子のダイレクトシークエンスを行い，その解析を行った．30 例を解析した結果 27 例と 3 例の 2 つのグループに分類された．データベース株と比較したところ 27 例のグループはJ P-1 型に分類されるyeo-joo 株と，3 例のグループは JP-2 型に分類される CMM1，KNP1 及び KNP2 株とシークエンスが一致した．また，分子系統樹においてもそれぞれがクラスターを形成し，27 例のグループは JP-1 型，3 例のグループは JP-2 型に分類されると判断された．わが国では，JP-2 型が主流と考えられてきたが，この地域では JP-1 型が主流である可能性がある．今後，この株を分離し精査する必要がある． |
|---|---|
| AbstractList | 山形県，新潟県及び秋田県で発生した Karp 型感染によるつつが虫病患者由来 Orientia tsutsugamushi 遺伝子の亜型分類を行った．30 人の患者血液から抽出された DNA を試料とし，nested-PCR で得られた O. tsutsugamushi の 56-kDa タンパク遺伝子のダイレクトシークエンスを行い，その解析を行った．30 例を解析した結果 27 例と 3 例の 2 つのグループに分類された．データベース株と比較したところ 27 例のグループはJ P-1 型に分類されるyeo-joo 株と，3 例のグループは JP-2 型に分類される CMM1，KNP1 及び KNP2 株とシークエンスが一致した．また，分子系統樹においてもそれぞれがクラスターを形成し，27 例のグループは JP-1 型，3 例のグループは JP-2 型に分類されると判断された．わが国では，JP-2 型が主流と考えられてきたが，この地域では JP-1 型が主流である可能性がある．今後，この株を分離し精査する必要がある． |
| Author | 大谷, 勝実 瀬戸, 順次 青木, 敏也 金子, 紀子 |
| Author_xml | – sequence: 1 fullname: 大谷, 勝実 organization: 山形大学大学院医学系研究科公衆衛生学講座 – sequence: 1 fullname: 青木, 敏也 organization: 山形県村山保健所 – sequence: 1 fullname: 金子, 紀子 organization: 山形県衛生研究所 – sequence: 1 fullname: 瀬戸, 順次 organization: 山形県衛生研究所 |
| BookMark | eNptkEtLAzEUhYMoWB__YcD11GQmmUmW4huVbhTcDbc1006ro0zaha5sSkXQhYIgghVEBaGoiAtRCv6YtD7-hfWBK-FwL5x7-A7cAdQbr8cSoRGC04QQhkdLECsZq8J6HkqVLVCqEKU5S3uO14NShHNqM08s96IUdrlvM0FIPxpWKspijAXFDnNSSJvq5bf230-ab8f1V33xvl1_O7p_bVyZ6q01B8mG1TnbszJJJONyBFZZVbrKw1ql22cxzy5NgGX0i6k9mNqh0Xcf1ed2q9G5OTD60dRaXcfo66-rfjLVptG7Ru-1n0-70M7uzsf52RDqC2FVyeHfPYiWpiYXx2fs-cz07PjYvF10KMW2G2bBY6HrM0xkSMMQA-WMUGCcYyzFCqYCSx8Ik5IIiSnJCeEIzv0VwnzsuoNo4YdbVGXIy2AjidYg2QwgKUe5VRn8886As8D7Ho73l8sVIAmK4H4CbvGZ6g |
| ContentType | Journal Article |
| Copyright | 2011 社団法人 日本感染症学会 |
| Copyright_xml | – notice: 2011 社団法人 日本感染症学会 |
| DOI | 10.11150/kansenshogakuzasshi.85.626 |
| DatabaseTitleList | |
| DeliveryMethod | fulltext_linktorsrc |
| EISSN | 1884-569X |
| EndPage | 631 |
| ExternalDocumentID | article_kansenshogakuzasshi_85_6_85_626_article_char_ja |
| GroupedDBID | ALMA_UNASSIGNED_HOLDINGS JSF KQ8 OK1 RJT SJN |
| ID | FETCH-LOGICAL-j2440-3fba65f37501ef4ff0a48514a58800e9d0490e7a15ee19e041c9929887d157033 |
| ISSN | 0387-5911 |
| IngestDate | Wed Sep 03 06:30:34 EDT 2025 |
| IsDoiOpenAccess | true |
| IsOpenAccess | true |
| IsPeerReviewed | false |
| IsScholarly | true |
| Issue | 6 |
| Language | Japanese |
| LinkModel | OpenURL |
| MergedId | FETCHMERGED-LOGICAL-j2440-3fba65f37501ef4ff0a48514a58800e9d0490e7a15ee19e041c9929887d157033 |
| OpenAccessLink | https://www.jstage.jst.go.jp/article/kansenshogakuzasshi/85/6/85_626/_article/-char/ja |
| PageCount | 6 |
| ParticipantIDs | jstage_primary_article_kansenshogakuzasshi_85_6_85_626_article_char_ja |
| PublicationCentury | 2000 |
| PublicationDate | 2011/11/20 |
| PublicationDateYYYYMMDD | 2011-11-20 |
| PublicationDate_xml | – month: 11 year: 2011 text: 2011/11/20 day: 20 |
| PublicationDecade | 2010 |
| PublicationTitle | 感染症学雑誌 |
| PublicationTitleAlternate | 感染症誌 |
| PublicationYear | 2011 |
| Publisher | 一般社団法人 日本感染症学会 |
| Publisher_xml | – name: 一般社団法人 日本感染症学会 |
| References | 4) 最上久美子，池田辰也，大谷勝実：山形県における過去 10 年間のつつが虫病発生状況．山形衛研報 2005；38：33―5. 6) Ohashi N, Koyama Y, Urakami H, Fukuhara M, Tamura A, Kawamori F, et al.：Demonstration of antigenic and genotypic variation in Orientia tsutsugamushi which were isolated in Japan, and their classification into type and subtype. Microbiol Immunol 1996；40：623―38. 14) Ogawa M, Ono T：Epidemiological characteristics of tsutsugamushi disease in Oita Prefecture, Japan : yearly and monthly occurrences of its infections and serotypes of its causative agent, Orientia tsutsugamushi, during 1984-2005. Micro 5) 田原研司，山本正悟：つつが虫病―多種多彩な疫学―．SADI 組織委員会編，ダニと新興再興感染症．全国農村教育協会，東京，2007；p. 151― 63. 8) Furuya Y, Yoshida Y, Katayama T, Yamamoto S, Kawamura A Jr：Serotype-specific amplification of Rickettsia tsutsugamushi DNA by nested polymelase chain reaction. J Clin Microbiol 1993；31：1637―40. 15) 島津幸枝，谷澤由枝，高尾信一，田原研司，藤田博巳，矢野泰弘，他：広島県内の野鼠におけるつつが虫病リケッチア侵淫状況．広島技研保健環境セ研報 2009；17：15―20. 7) Enatsu T, Urakami H, Tamura A：Phylogenetic analysis of Orientia tsutsugamushi strains based on the sequence homologies of 56-kDa type-specific antigen genes. FEMS Microbiol Lett 1999；180：163―9. 9) Ohashi N, Nashimoto H, Ikeda H, Tamura A：Diversity of immunodominant 56-kDa type-specific antigen (TSA) of Rickettia tsutsugamushi :sequence and comparative analyses of the genes encording TSA homologues from four antigenic variants. J Biol Chem 1992；267：12728―35. 2) 佐藤寛子，國生泰範，柴田ちひろ，斎藤博之，齊藤志保子，藤田博己，他：秋田県において15 年ぶりに確認された古典型つつが虫病の 1 例．感染症誌 2010；84：454―6. 10) Kelly DJ, Fuerst PA, Ching WM, Richards AL：Scrub typhus : the geographic distribution of phenotypic and genotypic variants of Orientia tsutsugamushi. Clin Infect Dis 2009；48 (Suppl 3）：S203―30. 16) 金子紀子，瀬戸順次，大谷勝実，角坂照貴：山形県におけるツツガムシ生息調査．衛生動物 2010；61：79―84. 1) 多村憲：恙虫病病原体 Orientia tsutsugamushi の微生物学．日細菌誌 1999；54：815―32. 3) 大谷勝実，金子紀子，青木敏也，藤田博己：山形県で発生した Shimokoshi 型リケッチア感染によるつつが虫病の 1 例．衛生動物 2009；60：317―21. 13) 13）Tamura A, Makisaka Y, Kadosaka T, Enatsu T, Okubo K, Koyama S, et al.：Isolation of Orientia tsutsugamushi from Leptotrombidium fuji and its characterization. Microbiol Immunol 2000；44：201―4. 11) Urakami H, Takahashi M, Misumi H, Okubo K, Enatsu T, Tamura A：Detection, isolation and characterization of Orientia tsutsugamushi in Leptotrombidium intermedium. Med Entomol Zool 2000；51：169―77. 12) Tamura A, Yamamoto N, Koyama S, Makisaka Y, Takahashi M, Urabe K, et al.：Epidemiological survey of Orientia tsutsugamushi distribution in field rodents in Saitama prefecture, Japan,and discovery of a new type. Microbiol Immunol 2001；45：439―46. |
| References_xml | – reference: 8) Furuya Y, Yoshida Y, Katayama T, Yamamoto S, Kawamura A Jr：Serotype-specific amplification of Rickettsia tsutsugamushi DNA by nested polymelase chain reaction. J Clin Microbiol 1993；31：1637―40. – reference: 4) 最上久美子，池田辰也，大谷勝実：山形県における過去 10 年間のつつが虫病発生状況．山形衛研報 2005；38：33―5. – reference: 12) Tamura A, Yamamoto N, Koyama S, Makisaka Y, Takahashi M, Urabe K, et al.：Epidemiological survey of Orientia tsutsugamushi distribution in field rodents in Saitama prefecture, Japan,and discovery of a new type. Microbiol Immunol 2001；45：439―46. – reference: 9) Ohashi N, Nashimoto H, Ikeda H, Tamura A：Diversity of immunodominant 56-kDa type-specific antigen (TSA) of Rickettia tsutsugamushi :sequence and comparative analyses of the genes encording TSA homologues from four antigenic variants. J Biol Chem 1992；267：12728―35. – reference: 15) 島津幸枝，谷澤由枝，高尾信一，田原研司，藤田博巳，矢野泰弘，他：広島県内の野鼠におけるつつが虫病リケッチア侵淫状況．広島技研保健環境セ研報 2009；17：15―20. – reference: 10) Kelly DJ, Fuerst PA, Ching WM, Richards AL：Scrub typhus : the geographic distribution of phenotypic and genotypic variants of Orientia tsutsugamushi. Clin Infect Dis 2009；48 (Suppl 3）：S203―30. – reference: 1) 多村憲：恙虫病病原体 Orientia tsutsugamushi の微生物学．日細菌誌 1999；54：815―32. – reference: 2) 佐藤寛子，國生泰範，柴田ちひろ，斎藤博之，齊藤志保子，藤田博己，他：秋田県において15 年ぶりに確認された古典型つつが虫病の 1 例．感染症誌 2010；84：454―6. – reference: 5) 田原研司，山本正悟：つつが虫病―多種多彩な疫学―．SADI 組織委員会編，ダニと新興再興感染症．全国農村教育協会，東京，2007；p. 151― 63. – reference: 7) Enatsu T, Urakami H, Tamura A：Phylogenetic analysis of Orientia tsutsugamushi strains based on the sequence homologies of 56-kDa type-specific antigen genes. FEMS Microbiol Lett 1999；180：163―9. – reference: 11) Urakami H, Takahashi M, Misumi H, Okubo K, Enatsu T, Tamura A：Detection, isolation and characterization of Orientia tsutsugamushi in Leptotrombidium intermedium. Med Entomol Zool 2000；51：169―77. – reference: 6) Ohashi N, Koyama Y, Urakami H, Fukuhara M, Tamura A, Kawamori F, et al.：Demonstration of antigenic and genotypic variation in Orientia tsutsugamushi which were isolated in Japan, and their classification into type and subtype. Microbiol Immunol 1996；40：623―38. – reference: 14) Ogawa M, Ono T：Epidemiological characteristics of tsutsugamushi disease in Oita Prefecture, Japan : yearly and monthly occurrences of its infections and serotypes of its causative agent, Orientia tsutsugamushi, during 1984-2005. Micro – reference: 16) 金子紀子，瀬戸順次，大谷勝実，角坂照貴：山形県におけるツツガムシ生息調査．衛生動物 2010；61：79―84. – reference: 3) 大谷勝実，金子紀子，青木敏也，藤田博己：山形県で発生した Shimokoshi 型リケッチア感染によるつつが虫病の 1 例．衛生動物 2009；60：317―21. – reference: 13) 13）Tamura A, Makisaka Y, Kadosaka T, Enatsu T, Okubo K, Koyama S, et al.：Isolation of Orientia tsutsugamushi from Leptotrombidium fuji and its characterization. Microbiol Immunol 2000；44：201―4. |
| SSID | ssib000940252 ssib008799519 ssib058493432 ssib000959785 ssib020873179 ssib028667260 ssib002821772 ssj0000816464 ssib003038878 ssib002670505 ssib050995440 |
| Score | 1.9298738 |
| Snippet | 山形県，新潟県及び秋田県で発生した Karp 型感染によるつつが虫病患者由来 Orientia tsutsugamushi 遺伝子の亜型分類を行った．30 人の患者血液から抽出された DNA を試... |
| SourceID | jstage |
| SourceType | Publisher |
| StartPage | 626 |
| Title | つつが虫病患者由来の Karp 型 Orientia tsutsugamushi 56-kDa タンパク遺伝子シークエンスによる亜型分類 |
| URI | https://www.jstage.jst.go.jp/article/kansenshogakuzasshi/85/6/85_626/_article/-char/ja |
| Volume | 85 |
| hasFullText | 1 |
| inHoldings | 1 |
| isFullTextHit | |
| isPrint | |
| ispartofPNX | 感染症学雑誌, 2011/11/20, Vol.85(6), pp.626-631 |
| journalDatabaseRights | – providerCode: PRVAFT databaseName: Open Access Digital Library customDbUrl: eissn: 1884-569X dateEnd: 20141231 omitProxy: true ssIdentifier: ssj0000816464 issn: 0387-5911 databaseCode: KQ8 dateStart: 19700101 isFulltext: true titleUrlDefault: http://grweb.coalliance.org/oadl/oadl.html providerName: Colorado Alliance of Research Libraries |
| link | http://utb.summon.serialssolutions.com/2.0.0/link/0/eLvHCXMwrR1Na9RANJQK4kUUFb9Z0DktW_M1k5njJM1SFBWhhd6W7CbbdottaXcvPbkplUI9KAgi2IKoIBQV8SCWgj8m_fwXvjdJdtNSoRaXEGbfzLyZ95GZ95KZN5p2F0PIRHoUVkzeBAcFDHx4pJhdYY26GYI3FhhK0g8fsZEx-_44HR8YLK5a6rTrQ43FY_eVnEaqAAO54i7Zf5BsDykAIA3yhTtIGO4nkjHxLbAEibSPJrhHfE6EINIlvkOEQzglPiPcJNLCLK4rCGTZxDUwSwwTSXM8Pm4SmysTnxLhE-6WH8-r6KtBub3QgWsieNpZmJwqU1aZHg7KqppJ3KpKWMS1soQwsiwJWQJRu5L40KSH7QF2OUyEnld38upeoVaa4IcxQ2GR99XNIJznCVc1IYnwegRgAgpwht2QBgCLVrlijU1EVTGiSoSVc83JOilVReEqijiRElic66oqYhPpYI6rIx2gt6pFNyfTB7T98gLBwlSteUicKg9_oEpVdV4cKQ8dwZZzhqnyDnFtFGQO7Zd3ECw9RRZ0KcMPhOuKAwzzpFF84YMrDo2KqfceUdULpSeoLVxhc5BM11dMdZUiMRQI9DrltytTKhylSSlt3sl4m6qELExLGI2ZimyKjNJpk3O7Qpk6FLk3r6ZHMWXjR3GSZCYr2FsstQKOmcopLn6dDvAby8Lk7EQw3VkEh3JyaojToR6OQ7HSsyexdkylGqc1pm4mq-XlcGdjrQXu1RkTjAI8-eXBk4J3ImzwCArWvwDvuxDqyWQOngNZfHthOE4xGp8FU3gfH8fgi_3oiSYALKP_kdzkjDlm_20FmPKC2v1QTOAqiN42cGVocgwOmAbIy2RyVruT8-7e3zkH1nYLfM983aoypUcvaOczH7gkU_Zc1AZawSUtTrof1fVi_-3G3pvl3fjD_rPlvdffd9c-Jd2vJRyQSjvrq6V8KCodGopK6VBUSuLfydKPZOlVEn876G5ub63tfHmZxD-TpS2AJPFnzI1_Jd2NJF5J4tXtzXeAdGfl-cH79cvaWNUf9UYq2QExlZaJa1KsZj1gtGmB12NETbvZ1AMbPEg7oGCV6JEIcVlD5AQGjSJDRLptNAS4gyCU0MDIg9YVbXBmdia6qpXCRsOKdN6gYRjYoaDcCeoBhV9oCxow55pWTVlWm0ujANVOqWvX_xeiG9q5_uhwUxtsz3eiW-Agteu3lRr_AaZHLdQ |
| linkProvider | Colorado Alliance of Research Libraries |
| openUrl | ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info%3Aofi%2Fenc%3AUTF-8&rfr_id=info%3Asid%2Fsummon.serialssolutions.com&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rft.genre=article&rft.atitle=%E3%81%A4%E3%81%A4%E3%81%8C%E8%99%AB%E7%97%85%E6%82%A3%E8%80%85%E7%94%B1%E6%9D%A5%E3%81%AE+Karp+%E5%9E%8B+Orientia+tsutsugamushi+56-kDa+%E3%82%BF%E3%83%B3%E3%83%91%E3%82%AF%E9%81%BA%E4%BC%9D%E5%AD%90%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%AF%E3%82%A8%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%81%AB%E3%82%88%E3%82%8B%E4%BA%9C%E5%9E%8B%E5%88%86%E9%A1%9E&rft.jtitle=%E6%84%9F%E6%9F%93%E7%97%87%E5%AD%A6%E9%9B%91%E8%AA%8C&rft.au=%E5%A4%A7%E8%B0%B7%2C+%E5%8B%9D%E5%AE%9F&rft.au=%E9%9D%92%E6%9C%A8%2C+%E6%95%8F%E4%B9%9F&rft.au=%E9%87%91%E5%AD%90%2C+%E7%B4%80%E5%AD%90&rft.au=%E7%80%AC%E6%88%B8%2C+%E9%A0%86%E6%AC%A1&rft.date=2011-11-20&rft.pub=%E4%B8%80%E8%88%AC%E7%A4%BE%E5%9B%A3%E6%B3%95%E4%BA%BA+%E6%97%A5%E6%9C%AC%E6%84%9F%E6%9F%93%E7%97%87%E5%AD%A6%E4%BC%9A&rft.issn=0387-5911&rft.eissn=1884-569X&rft.volume=85&rft.issue=6&rft.spage=626&rft.epage=631&rft_id=info:doi/10.11150%2Fkansenshogakuzasshi.85.626&rft.externalDocID=article_kansenshogakuzasshi_85_6_85_626_article_char_ja |
| thumbnail_l | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/lc.gif&issn=0387-5911&client=summon |
| thumbnail_m | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/mc.gif&issn=0387-5911&client=summon |
| thumbnail_s | http://covers-cdn.summon.serialssolutions.com/index.aspx?isbn=/sc.gif&issn=0387-5911&client=summon |