次世代シークエンス用アリル判定プログラム（SeaBass）の開発とその検証

• Published in: 日本組織適合性学会誌 Vol. 22; no. 2; pp. 102 - 107
• Main Authors: 猪子, 英俊, 重成, 敦子, 鈴木, 進悟, 桝屋, 安里, 尾崎, 有紀, 椎名, 隆, 光永, 滋樹
• Format: Journal Article
• Language: Japanese
• Published: 日本組織適合性学会 2015
• Subjects: DNAタイピング; アリル; ヒト白血球抗原; 次世代シークエンサー
• ISSN: 2186-9995; 2187-4239
• DOI: 10.12667/mhc.22.102

膨大な次世代シークエンスデータを用いるアリル判定法の開発は，HLA DNAタイピングの簡略化や迅速化のために必要である。筆者らは，次世代シークエンス用アリル判定プログラム（SeaBass）を開発し，極めて高い精度でアリル判定が可能であることを確認した。したがって，SeaBassは新規アリルやnullアリルの検出のための優れたアリル判定ツールの一つであると考えられる。