红麻线粒体基因atp9克隆及不育细胞质分子标签的利用

【目的】快速克隆红麻线粒体atp9基因编码区（CDS）序列并分析其系统进化关系,为atp9基因功能验证奠定基础;利用基于atp9基因开发的不育细胞质分子标签MM556检测红麻种质资源的细胞质育性,为鉴定红麻不育细胞质种质资源提供参考。【方法】以红麻细胞质雄性不育系P3A及保持系P3B为材料,采用同源克隆方法克隆线粒体基因atp9的CDS区并进行序列比对和进化分析。利用分子标签MM556对84份未知细胞质育性的红麻种质资源进行不育细胞质材料筛选,并利用6个金钱吊芙蓉品种进行验证。【结果】红麻细胞质雄性不育系与保持系的CDS区碱基均为339 bp,两者间存在4个碱基的差异,推导编码112个氨基酸。...

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Published in南方农业学报 Vol. 46; no. 6; pp. 964 - 970
Main Author 赵艳红 廖小芳 赵洪涛 黄其椿 唐兴富 李初英 周瑞阳
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广西农业科学院经济作物研究所,南宁530007%广西大学农学院,南宁,530005%广西农业科学院经济作物研究所,南宁,530007 2015
广西大学农学院,南宁530005
Subjects
atp9
不育细胞质
分子标签
红麻
育性检测
atp9
红麻
育性检测
fertility detection
不育细胞质
molecular tag
分子标签
male sterile cytoplasm
kenaf (Hibiscus cannabinus L.)
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ISSN2095-1191
DOI10.3969/j.issn.2095-1191.2015.6.964

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Summary:【目的】快速克隆红麻线粒体atp9基因编码区（CDS）序列并分析其系统进化关系,为atp9基因功能验证奠定基础;利用基于atp9基因开发的不育细胞质分子标签MM556检测红麻种质资源的细胞质育性,为鉴定红麻不育细胞质种质资源提供参考。【方法】以红麻细胞质雄性不育系P3A及保持系P3B为材料,采用同源克隆方法克隆线粒体基因atp9的CDS区并进行序列比对和进化分析。利用分子标签MM556对84份未知细胞质育性的红麻种质资源进行不育细胞质材料筛选,并利用6个金钱吊芙蓉品种进行验证。【结果】红麻细胞质雄性不育系与保持系的CDS区碱基均为339 bp,两者间存在4个碱基的差异,推导编码112个氨基酸。红麻atp9基因与葡萄的亲缘关系最近,其节点支持率为72,其次为十字花科的油菜和拟南芥,与韭菜亲缘关系最远。MM556分子标签鉴定结果表明,84份红麻种质资源中,UG93-2ms-1、UG93-2ms-2、UG93-2ms-3、UG93-2ms-4、UG93-2-22、KN250、KN250-1、KN142、ZB90和09-7等10份材料具有不育细胞质,其中UG93-2ms-1、UG93-2ms-2、UG93-2ms-3和UG93-2ms-4均为红麻野败型UG93雄性不育突变体的衍生株系。经对金钱吊芙蓉品种的分子检测和田间育性验证,发现MM556分子标签同样适用于金钱吊芙蓉材料育性的辨别。【结论】克隆获得的红麻atp9基因编码区序列及筛选获得的不育细胞质种质资源可用于进一步研究红麻细胞质雄性不育分子机理;基于atp9基因开发的分子标签MM556可用于红麻不育细胞质的鉴定。
Bibliography:45-1381/S
ZHAO Yan-hong, LIAO Xiao-fang, ZHAO Hong-tao, HUANG Qi-chun, TANG Xing-fu, LI Chu-ying, ZHOU Rui-yang. （1Agricultural College, Guangxi University, Nanning 530005, China; 2Cash Crops Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China）
Objective】The present study was conducted to clone the coding sequence（CDS） region of mitochondrial atp9 gene of kenaf and analyze its evaluation relationships with other crops in order to lay the foundation for atp9 gene function verification. A molecular marker MM556 associated with male sterile cytoplasm, which was developed based on gene atp9, was used for detecting the fertility of kenaf germplasm resources in order to provide references for detecting kenaf male sterile cytoplasm germplasm resources. 【Method】The CDS region was cloned from kenaf cytoplasmic male sterility（CMS） line P3 A and its maintainer line P3 B by using homological cloning method, followed by sequence alignment between P3 A and P3 B. The phylogenetic tree of gene a
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2015.6.964