地理隔离对西南藏区山杨居群遗传结构影响的SRAP分析

采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析.结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带（AP）99条,多态性条带百分比（PPB）为59.28％.采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率（PPB）为33.80％,Nei＆#39;s基因多样性指数（H）和Shannon＆#39;s信息指数（Ⅰ）分别为0.1309和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性.遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间.地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系（r =0.349,P=94.5％）,山脉阻隔效应是...

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Published in林业科学研究 Vol. 28; no. 2; pp. 152 - 157
Main Author 何承忠 李佳蔓 员涛 纵丹 周安佩 欧光龙 尹五元
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 西南山地森林资源保护与利用省部共建教育部重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224%云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224 2015
西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224%西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224%西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224
西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224
云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224
西南山地森林资源保护与利用省部共建教育部重点实验室,西南林业大学,云南昆明650224
Subjects
SRAP标记
地理隔离
山杨
遗传多样性
遗传结构
遗传多样性
地理隔离
SRAP标记
Populus davidiana
geographical isolation
genetic variation
genetic structure
SRAP markers
山杨
遗传结构
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ISSN1001-1498

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Summary:采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析.结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带（AP）99条,多态性条带百分比（PPB）为59.28％.采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率（PPB）为33.80％,Nei＆#39;s基因多样性指数（H）和Shannon＆#39;s信息指数（Ⅰ）分别为0.1309和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性.遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间.地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系（r =0.349,P=94.5％）,山脉阻隔效应是导致西南藏族地区山杨居群间遗传分化的主要因素.UPGMA聚类表明,甘孜地区4个居群与迪庆地区的维西居群具有较近的亲缘关系,迪庆地区的德钦、香格里拉居群和昌都地区2个居群的遗传相似度较高.基于西南藏族地区山杨遗传结构分析,建议实施就地保护的同时,建立山杨种质资源库,促进不同居群间的基因交流.
Bibliography:130 individuals of 9 Populus davidiana populations collected from 3 Tibetan-inhabited regions in southwest China were examined by sequence-related amplified polymorphism （SRAP） markers to determine the genetic struc- ture. 99 polymorphic loci were obtained from the 9 populations using 7 selected primers, and its percentage was 59.28%. As analyzed by POPGENE soft, the average percentage of polymorphic loci （PPB =33.80% ）, Nei＇s genetic diversity （H ＂-O. 130 9 ） and Shannon＇ s information index （I--0. 213 7 ） indicated that P. davidiana dis- tributed in Tibetan-inhabited regions in Southwest China held a lower level of genetic diversity than that of P. david- iana distributed in Northeast China. The coefficient gene differentiation （Gst） was 0.325 5, indicating more varia- tion existed in the individuals of the populations. A weak correlation was found between geographic distance and genetic distance （r = 0. 349 ,P = 94.5% ）, which indicated that the mountain barriers strongly influenced genetic differentiation
ISSN:1001-1498