粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建

• Published in: Guangxi nong ye ke xue Vol. 41; no. 4; pp. 297 - 302
• Main Author: 宋建东 黄悦悦 阳海宁 郑加兴 马增凤 刘驰 黄大辉 张月雄 李孝琼 黄金艳 李容柏
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007%广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007 2010; 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007; 广西大学农学院,南宁,530005%广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007; 广西农业科学院水稻研究所,南宁,530007%广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007%广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005; 广西农业科学院水稻研究所,南宁,530007; 广西大学生命科学与技术学院,南宁,530005
• Subjects: 单片段代换系; 多态性; 普通野生稻; 标记辅助选择; 粳稻; 普通野生稻; 多态性; 单片段代换系; 标记辅助选择; 粳稻
• ISSN: 1002-8161
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2010.04.001

以粳稻日本晴（O. sativa L. subsp. Japonica cv. Nipponbare）为受体和轮回亲本，以广西普通野生稻核心种质DP15为供体，通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体（Single segment substitution lines, SSSLs）。用覆盖水稻全基因组的563对SSR引物检测供体（DP15）和受体（日本晴）的多态性，从中挑选212对分布在水稻12条染色体上的多态性引物跟踪供体基因型。结果表明，在BC3F1代获得79个代换片段，这些片段基本上能相互重叠并覆盖水稻12条染色体，其中第1、第2条染色体含有的代换片段数最多，均为9个，第9、第10和第12条染色体含有的代换片段数最少且均为5个。79个代换片段长度为12．65—113．55cM，平均长度为54．3cM，总覆盖长度为4285．28cM，是水稻整个染色体组长度的2倍多，覆盖野生稻全基因组达98．89％。随机选取其中的6个代换株系用96个多态性引物检测其遗传背景，发现供体DNA残留率为7．3％－15．6％。今后将继续通过回交和标记辅助选择，以获得一整套覆盖普通野生稻全基因组的SSSLN，这将有助于研究稻种的起源、演变和分化以及普通野生稻的功能基因组。