基于cDNA-SCoT差异显示的甘蔗应答水分胁迫基因表达谱分析

• Published in: 南方农业学报 Vol. 47; no. 12; pp. 1999 - 2008
• Main Author: 吴凯朝 黄诚梅 邓智年 魏源文 曹辉庆 徐林 蒋胜理 吴建明 杨丽涛 李杨瑞
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室,南宁,530007%广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁,530007%广西大学/广西亚热带生物资源保护和利用重点实验室,南宁,530004 2016
• Subjects: cDNA-SCoT; 基因表达谱; 复水; 水分胁迫; 甘蔗; 甘蔗; cDNA-SCoT; water stress; 基因表达谱; gene expressing profile; 复水; rewatering; 水分胁迫; sugarcane
• ISSN: 2095-1191
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.12.1999

【目的】研究甘蔗应答水分胁迫差异基因表达,进一步探究甘蔗应答水分胁迫的分子机制,为开展甘蔗抗旱综合性遗传改良研究提供科学依据。【方法】选用GT11为材料,分别构建对照、干旱、复水3个处理总RNA混合池,使用cDNA-SCoT差异显示构建GT11伸长期应答水分胁迫的基因表达谱,筛选、分离TDFs进行测序,在NCBI数据库进行BLAST同源性检索,根据同源基因推测基因功能。【结果】通过42条SCoT引物筛选得到180个TDFs,有100个TDFs与NCBI数据库中已录入的基因具有较高的相似性,根据同源基因功能可分为14类：新陈代谢相关基因（11个）、能量代谢相关基因（12个）、运输途径相关基因（5个）、通信及信号转导相关基因（6个）、细胞循环及DNA加工相关基因（3个）、转录调控因子相关基因（3个）、蛋白质合成相关基因（17个）、蛋白质加工相关基因（1个）、结合功能蛋白相关基因（7个）、环境互作相关基因（3个）、转座子、毒性及质粒蛋白相关基因（5个）、细胞成分生物合成相关基因（1个）、防御相关基因（4个）和未知功能蛋白基因（22个）。【结论】甘蔗应答水分胁迫调节途径具有多样性、复杂性、协调性和网络性;应用cDNA-SCoT差异显示筛选获得水分胁迫相关TDFs,可为进一步研究甘蔗应答水分调控途径的分子机理提供重要信息。