70份毛葡萄种质资源遗传多样性的SSR分析

【目的】利用SSR标记进行毛葡萄遗传多样性的分析，阐明毛葡萄种质的亲缘关系，为有效利用野生毛葡萄种质及挖掘优良基因提供参考。【方法】利用筛选的多态性SSR引物对70份毛葡萄进行SSR扩增，评价不同种质遗传多样性，并分析亲缘关系。【结果】从40对SSR引物中筛选出16对多态性引物，共扩增出123 条带，每对引物可检测到等位位点数3-15个，多态率26.7%-100.0%。PopGene分析结果表明，毛葡萄种群Nei’s 基因多样性平均指数为0.4412，多样性信息平均指数为0.6308，具有较高的遗传多样性。Nei’s相似性系数分析结果表明，70份毛葡萄种质的遗传相似系数在0.60-0.89。U...

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Published in南方农业学报 Vol. 44; no. 12; pp. 1943 - 1948
Main Author 邹瑜 杨柳 黄大辉 吴代东 张进忠 赵明 林茜 潘永杰 林贵美 韦绍龙 欧昆鹏
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广西农业科学院 生物技术研究所 南宁530007%广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室 南宁530007%广西植物组培苗有限公司 南宁530007 2013
Subjects
SSR分析
毛葡萄
种质资源
聚类分析
遗传多样性
genetic diversity
germplasm resources
遗传多样性
种质资源
Vitis heyneana
SSR analysis
毛葡萄
cluster analysis
聚类分析
SSR分析
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ISSN2095-1191
DOI10.3969/j:issn.2095-1191.2013.12.1943

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Summary:【目的】利用SSR标记进行毛葡萄遗传多样性的分析，阐明毛葡萄种质的亲缘关系，为有效利用野生毛葡萄种质及挖掘优良基因提供参考。【方法】利用筛选的多态性SSR引物对70份毛葡萄进行SSR扩增，评价不同种质遗传多样性，并分析亲缘关系。【结果】从40对SSR引物中筛选出16对多态性引物，共扩增出123 条带，每对引物可检测到等位位点数3-15个，多态率26.7%-100.0%。PopGene分析结果表明，毛葡萄种群Nei’s 基因多样性平均指数为0.4412，多样性信息平均指数为0.6308，具有较高的遗传多样性。Nei’s相似性系数分析结果表明，70份毛葡萄种质的遗传相似系数在0.60-0.89。UPGMA 聚类分析结果表明，在遗传相似系数0.61 处，70 份毛葡萄材料可分为3大类群：第一类包含两份毛葡萄材料，编号为70和91，均来自广西罗城县；第二类包含5份材料，编号为28、1、129、3和131，除131外，其余4份来自广西罗城县；其他63份归为第三类，其中50份为广西罗城县毛葡萄。【结论】广西罗城县毛葡萄具有丰富的遗传多样性，可为毛葡萄种质资源的利用和品种选育提供参考。
Bibliography:ZOU Yu1, YANG Liu2., HUANG Da-hui2, WU Dai-dong , ZHANG Jin-zhong , ZHAO Ming, LIN Qian3, PAN Yong-jie3, LIN Gui-mei3, WEI Shao-long1, OU Kun-peng （1Bio-technology Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, China; 2 Guangxi Crop Improvement and Biotechnology Laboratory,Guangxi Academy of Agricuhural Sciences, Nanning 530007, China; 3Guangxi Plant Tissue Culture Company Limited, Nanning 530007, China）
Objective】The genetic diversity of Vitis heyneana was studied using SSR markers in order to understand the interrelationship and provide references on effective utilization of those germplasms and screening better genes. 【Method】By using the selected polymorphism SSR primers to amplify 70 accessions of Vitis heyneana germplasms, the genetic diversity and interrelationship were analyzed. 【Result】The results showed that 123 bands were amplified using 16 pairs of polymorphic primers screened from 40 pairs, and 3 to 15 allelic loci were detected by each pair of primers, with the poly
ISSN:2095-1191
DOI:10.3969/j:issn.2095-1191.2013.12.1943