基于白木香 ESTs 的沉香属 SSR 分子标记引物筛选
通过对白木香样品的454GSFLXTitanium高通量测序，获取了大量白木香EST序列，从中搜索出956个SSR，根据引物设计标准，设计了44对EST—SSR引物。在合适的PCR反应体系下，以海南白木香样品的DNA为模板，对设计的EST—SSR引物进行筛选，发现有22对EST—SSR引物能较好地扩增出产物。在沉香属3个种9份样品中进一步对这些可扩增的引物进行多态性初步验证，所筛选引物均可在所有沉香属样品中使用，为后续白木香居群及沉香属植物遗传多样性分析奠定基础。...
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| Published in | 江西农业学报 Vol. 26; no. 5; pp. 76 - 79 |
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| Main Author | |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所，北京100193%中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 海南分所/海南省南药资源保护与开发重点实验室,海南 万宁,571533
2014
中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所 海南分所/海南省南药资源保护与开发重点实验室，海南 万宁 571533 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1001-8581 |
Cover
| Summary: | 通过对白木香样品的454GSFLXTitanium高通量测序，获取了大量白木香EST序列，从中搜索出956个SSR，根据引物设计标准，设计了44对EST—SSR引物。在合适的PCR反应体系下，以海南白木香样品的DNA为模板，对设计的EST—SSR引物进行筛选，发现有22对EST—SSR引物能较好地扩增出产物。在沉香属3个种9份样品中进一步对这些可扩增的引物进行多态性初步验证，所筛选引物均可在所有沉香属样品中使用，为后续白木香居群及沉香属植物遗传多样性分析奠定基础。 |
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| Bibliography: | 36-1124/S Aquilaria sinensiz; EST- SSR marker; Polymorphic primers; Screening YANG Yun, ZHANG Zheng, CHEN Bo , MENG Hui1 （ 1. Hainan Branch, Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences ＆ Peking Union Medical College; Hainan Provincial Key Laboratory of Conservation and Development of Southern Medicine Resources, Wanning 571533, China; 2. Institute of Medicinal Plant Development, Chinese Academy of Medical Sciences ＆ Peking Union Medical College, Bei- jing 100193, China） A large amount of Aquilaria sinensis （Lour.） Gilg EST sequences were obtained through high -throughput sequen- cing by 45gGS FLX Titanium. From these EST sequences, 956 SSRs were selected. Forty - four pairs of EST - SSR primers were designed to amplify flanking SSRs from 956 selected SSR - ESTs. Twenty - two pairs of primers were confirmed to be efficient in A. sinensis. The preliminary validation of the polymorphism of these 22 pairs of primers was further carried out in 9 samples of 3 species in Aquilaria, and |
| ISSN: | 1001-8581 |