小菜蛾传染性软腐病病毒的全基因组序列及其进化分析

传染性软腐病病毒（Iflavirus）属于小核糖核酸病毒目,是一类单股正链RNA病毒,其家族成员正在不断扩大。Iflavirus的寄主包括鳞翅目、膜翅目和半翅目的昆虫以及瓦螨,因其对一些重要的农业害虫产生致病性,因此是重要的潜在生防病毒种类之一。本研究利用小菜蛾转录组测序数据拼接出一条Iflavirus病毒基因组序列。通过查找ORF和序列相似性比对发现此基因组可编码一条完整的病毒多聚蛋白并与其他Iflavirus病毒同源,因此将这一新病毒命名为小菜蛾传染性软腐病病毒（Diamondback moth iflavirus）,英文简称DBMIV。通过多聚蛋白序列与RNA聚合酶序列构建的进化树表明D...

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Published in环境昆虫学报 Vol. 39; no. 3; pp. 618 - 631
Main Author 陈大嵩 戴建青 韩诗畴
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广东省生物资源应用研究所,广东省动物保护与资源利用重点实验室,广东省野生动物保护与利用公共实验室,广州510260 2017
Subjects
传染性软腐病病毒
基因组
小菜蛾
系统进化
系统进化
Plutella xylostella
genome
传染性软腐病病毒
Iflavirus
phylogenetics
小菜蛾
基因组
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ISSN1674-0858
DOI10.3969/j.issn.1674-0858.2017.03.17

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Summary:传染性软腐病病毒（Iflavirus）属于小核糖核酸病毒目,是一类单股正链RNA病毒,其家族成员正在不断扩大。Iflavirus的寄主包括鳞翅目、膜翅目和半翅目的昆虫以及瓦螨,因其对一些重要的农业害虫产生致病性,因此是重要的潜在生防病毒种类之一。本研究利用小菜蛾转录组测序数据拼接出一条Iflavirus病毒基因组序列。通过查找ORF和序列相似性比对发现此基因组可编码一条完整的病毒多聚蛋白并与其他Iflavirus病毒同源,因此将这一新病毒命名为小菜蛾传染性软腐病病毒（Diamondback moth iflavirus）,英文简称DBMIV。通过多聚蛋白序列与RNA聚合酶序列构建的进化树表明DBMIV与PNV、EOPLV和SEIV2进化关系最近。最后,利用RT-PCR扩增出DBMIV的外壳蛋白区域验证了新命名病毒在田间小菜蛾种群的感染。DBMIV的鉴定与命名为利用高通量测序数据鉴定病毒新种提供参考,为利用病毒生防重要蔬菜害虫小菜蛾提供研究思路。
Bibliography:Plutella xylostella; Iflavirus; genome; phylogenetics
44-1640/Q
CHEN Da-Song, DAI Jian-Qing , HAN Shi-Chou （ Guangdong Key Laboratory of Animal Conservation and Resource Utilization, Guangdong Public Laboratory of Wild Animal Conservation and Utilization, Guangdong Institute of Applied Biological Resources, Guangzhou 510260, China）
The growing number of Iflaviruses are positive strind RNA viruses, which belong to Picornavirales. The hosts of Iflaviruses include Lepidoptera, Hymenoptera, Hemiptera and Varroa destructor. Iflaviruses are pathogenic to some main agricultural pests and are the potential viruses that could be used in biological control. In this study we assembled a complete Iflavirus genome from the transcriptome data of diamond moth. We find an ORF in this genome which can encode a complete polyprotein homologue to other Iflavirus genomes. Therefore,we nominate this new virus as Diamondback moth iflavirus,and the abbreviation is DBMIV. The phylogenetic analysis based on the polyprotein and RNA polyme
ISSN:1674-0858
DOI:10.3969/j.issn.1674-0858.2017.03.17