思茅松HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶（HDR）是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸（MEP）途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用.该研究根据思茅松（Pinus kesiya var．langbianensis ）树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因片段,然后根据所获得的基因片段设计特异引物,提取受伤后的思茅松树皮的RNA,并运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的HDR 基因（PkHDR）.生物信息学分析表明：克隆获得的PkHDR1基因cDNA全长序列为1876 bp,含有1个1464 bp的开放阅读框（ORF）,编码487个氨基酸.同源性...

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Published in广西植物 Vol. 35; no. 5; pp. 721 - 727
Main Author 王毅 周旭 毕玮 杨宇明 李江 王娟
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 云南林业科学院 国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室，昆明 650201 2015
云南林业学科院，云南省森林植物培育与开发利用重点实验室，昆明 650201%西南林业大学,昆明,650224%云南林业学科院，云南省森林植物培育与开发利用重点实验室，昆明 650201
Subjects
cDNA
克隆
基因功能分析
思茅松
半定量PCR
cD-NA clone
cDNA 克隆
gene function analysis
1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase gene
RT-PCR
HDR
基因功能分析
Pinus kesiya var.langbianensis
思茅松
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ISSN1000-3142
DOI10.11931/guihaia.gxzw201409048

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Summary:1-羟基-2-甲基-2-E-丁烯基-4-焦磷酸还原酶（HDR）是甲基-D-赤藓醇-4-磷酸（MEP）途径中的最后一个酶,在植物萜类生物合成中起主控作用.该研究根据思茅松（Pinus kesiya var．langbianensis ）树皮转录组数据分析结果,首先获得了思茅松HDR基因片段,然后根据所获得的基因片段设计特异引物,提取受伤后的思茅松树皮的RNA,并运用RT-PCR和RACE技术从思茅松树皮中克隆得到完整的HDR 基因（PkHDR）.生物信息学分析表明：克隆获得的PkHDR1基因cDNA全长序列为1876 bp,含有1个1464 bp的开放阅读框（ORF）,编码487个氨基酸.同源性分析结果表明：思茅松 HDR蛋白与赤松（Pinus densiflora）HDR蛋白的相似性高达99％.亚细胞定位及结构域分析结果表明：思茅松PkHDR氨基酸序列中包含转运肽序列（A1-A61）及植物 HDR蛋白多个保守的功能位点（A143,A234,A288,A371）.系统进化分析结果表明：PkHDR蛋白与赤松 HDR蛋白的亲缘关系最为接近.半定量PCR检测结果表明：树皮的创伤促进思茅松HDR基因的表达.该研究成功克隆获得HDR基因,并确定其与松脂代谢密切相关,为阐明思茅松松脂生物合成机制和分子育种提供了参考.
Bibliography:HDR;半定量PCR;Pinus kesiya var.langbianensis;1-hydroxy-2-methyl-2-（E）-butenyl 4-diphosphate reductase gene;cD-NA clone;gene function analysis;RT-PCR
WANG Yi, ZHOU Xu, BI Wei, YANG Yu-Ming, LI Jiang, WANG Juan （ 1. Key Laboratory of Rare and Endangered Forest Plants of State Forestry Administration, Yunnan Academy of Forestry, Kunming 650204, China~ 2. Key Laboratory of Foresty Plant Cultivation and Utilization ~ Yunnan AeadeTn y of Forestry Kunming 650204, China; 3. Faculty of Forestry, Southwest Forestry University, Kunming 650204, China ）
45-1134/Q
1-hydroxy-2-methyl-2-（E）-butenyl-4-diphosphate reductase（HDR）catalyzes the last step of the 2C-meth-yl-D-erythritol-4-phosphate（MEP）pathway,1-hydroxy-2-methyl-2-（E）-butenyl-4-diphosphate reductase plays an important role in regulation of terpenes biosynthesis.To explore the function of 1-hydroxy-2-methyl-2-（E）-butenyl-4-diphosphate reductase in Pinus kesiya var.langbianensis,and to study the role of 1-hydroxy-2-methyl-2-（E）-butenyl-4-diphosphate reductase in regulation
ISSN:1000-3142
DOI:10.11931/guihaia.gxzw201409048