诺卡氏菌mce1A基因的克隆及重组表达

诺卡氏菌（Nocardia seriolae）是近年来海淡水养殖鱼类频发慢性传染病的病原菌。该研究通过引物扩增得到全长1 254 bp、编码417个氨基酸的诺卡氏菌毒力因子mce1A基因的全序列。该基因编码蛋白质的分子量约为43.98 k D,理论等电点5.14,含有161个疏水性氨基酸,疏水性平均值为0.044,为疏水性蛋白,具有α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲3种结构。经预测,Mce1A有MCE、DUF3407区域、OM_asym_Mla D、Mtu_fam_mce、Mla D 5个结构域,彼此交叠,含有公共区域。根据Mce1A氨基酸构建的系统进化树可以发现诺卡氏菌和新星诺卡氏菌的亲缘...

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Published in南方水产科学 Vol. 13; no. 1; pp. 94 - 103
Main Author 高芳 许海东 徐力文 苏友禄 郭志勋 蒋魁 冯娟
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306%中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300 2017
中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300
Subjects
mce1A基因
原核表达
诺卡氏菌
Nocardia seriolae
mce1A
诺卡氏菌
prokaryotic expression
原核表达
mce1A基因
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ISSN2095-0780
DOI10.3969/j.issn.2095-0780.2017.01.012

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Summary:诺卡氏菌（Nocardia seriolae）是近年来海淡水养殖鱼类频发慢性传染病的病原菌。该研究通过引物扩增得到全长1 254 bp、编码417个氨基酸的诺卡氏菌毒力因子mce1A基因的全序列。该基因编码蛋白质的分子量约为43.98 k D,理论等电点5.14,含有161个疏水性氨基酸,疏水性平均值为0.044,为疏水性蛋白,具有α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲3种结构。经预测,Mce1A有MCE、DUF3407区域、OM_asym_Mla D、Mtu_fam_mce、Mla D 5个结构域,彼此交叠,含有公共区域。根据Mce1A氨基酸构建的系统进化树可以发现诺卡氏菌和新星诺卡氏菌的亲缘关系最近。构建p ET32a-mce1A重组质粒并转化至大肠埃希菌BL21中,得到的重组蛋白的相对分子量约63kD。温度、IPTG浓度对重组蛋白表达量没有影响。该研究为进一步研究Mce1A的致病机制奠定了基础。
Bibliography:GAO Fang1,2, XU Haidong1 , XU Liwen1 , SU Youlu1 , GUO Zhixun1 , JIANG Kui1,2, FENG Juan1 （1. Key Lab. of South China Sea Fishery Resource Exploitation ＆ Utilization, Ministry of Agricuhure; South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China; 2. College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 210306, China）
Nocardia seriolae; mce1A; prokaryotic expression
Nocardia seriolae,a bacterial fish pathogen of marine fish and freshwater fish,causing nocardiosis,can lead to mass loss of fish farming. The full-length（ 1 254 bp） of mce1 A c DNA in N. Seriolae was cloned in this study. The Mce1 A molecular weight was43. 98 k D; the theoretical isoelectric point and theoretical hydrophobic were 5. 14 and 0. 044,respectively. It contained 161 hydrophobic amino acids,as the hydrophobic proteins. The protein mainly consisted of random coil,and almost had no helix and folding.Sequence analysis indicates that it encoded 417 amino acids,and containe
ISSN:2095-0780
DOI:10.3969/j.issn.2095-0780.2017.01.012