斑节对虾泛素融合蛋白UbS27基因克隆与表达分析
从构建的斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选出泛素核糖体融合蛋白Ub S27基因(ubiquitin/ribosomal S27 fusion protein,Pm Ub S27)片段,利用SMART-RACE技术克隆出Pm Ub S27基因c DNA全长,并利用软件对其结构进行分析;利用实时荧光定量技术检测Pm Ub S27基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果显示,Pm Ub S27基因c DNA全长为514 bp,开放阅读框465 bp,编码154个氨基酸,含有泛素(1~72 aa)和核糖体蛋白(101~147 aa)2个结构域。以DNA为模板...
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Published in | 南方水产科学 Vol. 12; no. 1; pp. 77 - 84 |
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Main Author | |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
上海海洋大学水产与生命学院,上海 201306%中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300
2016
中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300 华南农业大学动物科学学院,广东 广州 510640%中国水产科学研究院南海水产研究所,农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东 广州 510300 |
Subjects | |
Online Access | Get full text |
ISSN | 2095-0780 |
DOI | 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.01.011 |
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Summary: | 从构建的斑节对虾(Penaeus monodon)肝胰腺转录组数据中筛选出泛素核糖体融合蛋白Ub S27基因(ubiquitin/ribosomal S27 fusion protein,Pm Ub S27)片段,利用SMART-RACE技术克隆出Pm Ub S27基因c DNA全长,并利用软件对其结构进行分析;利用实时荧光定量技术检测Pm Ub S27基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达情况。结果显示,Pm Ub S27基因c DNA全长为514 bp,开放阅读框465 bp,编码154个氨基酸,含有泛素(1~72 aa)和核糖体蛋白(101~147 aa)2个结构域。以DNA为模板克隆得到的基因序列由3个内含子和4个外显子组成。实时荧光定量结果显示,Pm Ub S27基因在斑节对虾各组织中均有表达,但是在卵巢中表达量最高,其次为肝胰腺、血淋巴和精巢。Pm Ub S27在卵巢发育前期(Ⅱ期)和成熟期(Ⅴ期)的表达量显著高于其他各期(P〈0.05)。结果表明,Pm Ub S27参与斑节对虾卵巢发育的过程并可能在卵巢发育进程中起到重要的调控作用。 |
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Bibliography: | Penaeus monodon; ovary development; ubiquitin / ribosomal S27 fusion protein; real-time quantitative PCR WU Song;TANG Lei;FU Mingjun;YANG Lishi;HUANG Jianhua;ZHOU Falin;JIANG Shigui(1. Key Lab. of South China Sea Fishery Resources Exploitation & Utilization, Ministry of Agriculture; South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China; 2. College of Fishery and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; 3. College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510460, China) We screened the ubiquitin / ribosomal S27 fusion protein( Pm Ub S27) from hepatopancreas transcriptome data of Penaeus monodon and cloned the full-length Pm Ub S27 c DNA sequence by SMART-RACE technology. Besides,we studied the expression of ovaries of Pm Ub S27 gene at different developmental stages and in different tissues by real-time quantitative detection. The Pm Ub S27 c DNA was 514 base pairs( bp) long,containing a 3'-UTR of 39 nucleotides |
ISSN: | 2095-0780 |
DOI: | 10.3969/j.issn.2095-0780.2016.01.011 |