全反式维甲酸对胶质瘤SHG-44细胞基因表达谱的影响

背景与目的:胶质瘤有恶性进展的趋势,而诱导分化治疗可诱导高级别肿瘤的分化,使肿瘤恶性程度降低甚或转为正常。本研究旨在检测全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA)处理后胶质瘤SHG-44细胞的基因表达谱改变.为进一步研究胶质瘤的基因治疗奠定基础。方法:以10μmol/LATRA处理SHG-44细胞后,提取总RNA进行反转录聚合酶链反应,并以荧光染料Cy3和Cv5标记cDNA产物,然后进行芯片杂交,检测ATRA诱导前后SHG-44细胞的基凶表达谱,获得差异表达基因;随机选择数个差异基因进行Northem杂交实验,以验证cDNA微阵列的结果。结果:应用cDNA微阵列检...

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Published inAi zheng Vol. 27; no. 5; pp. 482 - 490
Main Author 曾义 杨忠 韩杨云 游潮
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 四川大学华西医院神经外科,四川,成都610041 2008
四川德阳市人民医院神经外科,四川,德阳618000%第三军医大学神经生物学教研室,四川,成都400038%四川德阳市人民医院神经外科,四川,德阳618000%四川大学华西医院神经外科,四川,成都610041
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ISSN1000-467X
1944-446X
DOI10.3321/j.issn:1000-467X.2008.05.007

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Summary:背景与目的:胶质瘤有恶性进展的趋势,而诱导分化治疗可诱导高级别肿瘤的分化,使肿瘤恶性程度降低甚或转为正常。本研究旨在检测全反式维甲酸(all-trans retinoic acid,ATRA)处理后胶质瘤SHG-44细胞的基因表达谱改变.为进一步研究胶质瘤的基因治疗奠定基础。方法:以10μmol/LATRA处理SHG-44细胞后,提取总RNA进行反转录聚合酶链反应,并以荧光染料Cy3和Cv5标记cDNA产物,然后进行芯片杂交,检测ATRA诱导前后SHG-44细胞的基凶表达谱,获得差异表达基因;随机选择数个差异基因进行Northem杂交实验,以验证cDNA微阵列的结果。结果:应用cDNA微阵列检测发现ATRA处理前后的SHG-44细胞之间存在42个差异表达基因,其中表达上调28个、表达下调14个。这42个差异表达基因按功能分为:凋亡类3个、细胞迁移和转移类3个、细胞周期与生长调节类2个、细胞骨架类2个、分化类1个、细胞代谢类5个、癌基因1个、氧化磷酸化类1个、受体与信号传导类2个、核蛋白体类3个、泛素-蛋白酶系统类2个、生长因子与细胞因子类1个及其他类相关基因16个。结论:ATRA可引起胶质瘤SHG-44细胞基因表达谱的改变,上述差异表达基因可能不仅介导药物诱导胶质瘤分化的机制,而且调节胶质瘤的演进。
Bibliography:Differentially expressed genes
SHG-44 cells
AII-trans retinoic acid
cDNA microarray
44-1195/R
AII-trans retinoic acid; Astrocytoma; SHG-44 cells;Differentially expressed genes; cDNA microarray
R739.4
Astrocytoma
ISSN:1000-467X
1944-446X
DOI:10.3321/j.issn:1000-467X.2008.05.007