马铃薯StNF-YA9基因的生物信息学及其表达分析

S532; NF-Y是一种普遍存在于真核生物中的转录因子,通常以NF-YA/B/C异源三聚体的形式发挥作用,其中NF-YA转录因子通过特异性结合DNA启动子区域的CCAAT box,调控下游靶基因表达以应对胁迫.通过前期对马铃薯NF-Ys基因家族的分析,发现沉默马铃薯StNF-YA9基因,马铃薯对干旱胁迫更为敏感.因此,从马铃薯品种'Atlantic'中克隆了StNF-YA9基因,生物信息学分析表明该基因总长度为1 231 bp,CDS区长723 bp.通过构建StNF-YA9亚细胞定位融合表达载体确定其定位在细胞核中;采用qRT-PCR分析该基因组织和逆境胁迫下表达模式,...

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Published in中国马铃薯 Vol. 38; no. 2; pp. 97 - 185
Main Authors 徐文瑾, 范军亮, 李世贵, 王凯彤, 张宁, 司怀军
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 甘肃农业大学生命科学技术学院,甘肃 兰州 730070 2024
甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州 730070
省部共建干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃农业大学,甘肃 兰州 730070%省部共建干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃农业大学,甘肃 兰州 730070
Subjects
克隆
StNF-YA9
subcellular localization
亚细胞定位
potato
生物信息学分析
bioinformatics analysis
马铃薯
cloning
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ISSN1672-3635
DOI10.19918/j.cnki.1672-3635.2024.02.001

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Summary:S532; NF-Y是一种普遍存在于真核生物中的转录因子,通常以NF-YA/B/C异源三聚体的形式发挥作用,其中NF-YA转录因子通过特异性结合DNA启动子区域的CCAAT box,调控下游靶基因表达以应对胁迫.通过前期对马铃薯NF-Ys基因家族的分析,发现沉默马铃薯StNF-YA9基因,马铃薯对干旱胁迫更为敏感.因此,从马铃薯品种'Atlantic'中克隆了StNF-YA9基因,生物信息学分析表明该基因总长度为1 231 bp,CDS区长723 bp.通过构建StNF-YA9亚细胞定位融合表达载体确定其定位在细胞核中;采用qRT-PCR分析该基因组织和逆境胁迫下表达模式,结果表明其在叶片中相对表达量最高,芽中相对表达量最低,受到聚乙二醇(Polyethylene glycol,PEG)和脱落酸(Abscisic acid,ABA)诱导上调表达.研究结果为马铃薯StNF-YA9基因后续功能研究提供理论基础.
ISSN:1672-3635
DOI:10.19918/j.cnki.1672-3635.2024.02.001