马铃薯锌转运体基因StZnT2生物信息学及表达特性分析

S532; 锌是植物生长发育所必需的微量元素,缺锌或过量锌都会严重影响植物生长,锌转运蛋白对调节植物体内锌稳态具有重要作用.本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种'大西洋'试管苗为实验材料,克隆得到马铃薯锌转运体2(Solanum tuberosum zinc transporter 2,StZnT2)(GenBank No.XM_006358632.2)基因.结果表明,该基因全长1294 bp,CDS长1011 bp,编码336个氨基酸,蛋白相对分子量为36682.78 kD,理论等电点为5.63,属于疏水性跨膜蛋白,具有典型的ZIP保守结构域;亚细...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in农业生物技术学报 Vol. 30; no. 9; pp. 1676 - 1686
Main Authors 尹科, 赵婧, 唐勋, 赵贵宾, 朱永永, 党伟英, 张宁, 司怀军
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070 2022
甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室,兰州730070%甘肃省农业信息中心,兰州730030%甘肃省农业技术推广总站,兰州730020%甘肃农业大学生命科学技术学院,兰州730070
Subjects
生物信息学
锌
马铃薯锌转运体2 (StZnT2)
马铃薯
表达模式
Online AccessGet full text
ISSN1674-7968
DOI10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.003

Cover

More Information
Summary:S532; 锌是植物生长发育所必需的微量元素,缺锌或过量锌都会严重影响植物生长,锌转运蛋白对调节植物体内锌稳态具有重要作用.本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种'大西洋'试管苗为实验材料,克隆得到马铃薯锌转运体2(Solanum tuberosum zinc transporter 2,StZnT2)(GenBank No.XM_006358632.2)基因.结果表明,该基因全长1294 bp,CDS长1011 bp,编码336个氨基酸,蛋白相对分子量为36682.78 kD,理论等电点为5.63,属于疏水性跨膜蛋白,具有典型的ZIP保守结构域;亚细胞定位结果显示该蛋白定位于细胞膜上.同源蛋白比对分析表明,StZnT2基因编码的蛋白质与潘那利番茄(S.pen?nellii)、番茄(S.lycopersicum)和科民茄(S.commersonii)相似度最高.马铃薯在缺乏锌和过量锌培养条件下均表现出植株矮小、根系伸长受到抑制.实时荧光定量PCR分析不同锌浓度胁迫下基因的表达模式,结果表明,StZnT2在缺锌和过量锌胁迫下表达量均上调,且在根中表达水平最高.本研究结果为进一步阐明马铃薯StZnT2基因功能提供理论依据.
ISSN:1674-7968
DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2022.09.003