甜橙SPL基因家族的鉴定及其在成花诱导中的表达分析

Q786%Q789; SQUAMOSA promoter binding protein like(SPL)基因家族在植物成花转变与花器发育中起重要调控作用.该研究基于甜橙(Citrus sinensis)基因组数据,对甜橙SPL家族成员及其启动子区进行生物信息学分析,并采用qRT PCR检测其在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片的表达特异性,为深入探讨CsSPLs基因在甜橙成花诱导中的功能奠定基础.结果 表明:(1)共鉴定出15个含有SBP保守结构域的甜橙SPL基因,分别命名为CsSPL1～CsSPL15,且分布在6条染色体上.(2)CsSPL1～CsSPL15基因编码的氨基酸长度为130～1...

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Published in西北植物学报 Vol. 42; no. 1; pp. 48 - 56
Main Authors 杨杰, 陈蓉, 胡文娟, 吴巧玲, 陈健美, 李兴涛
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 赣南师范大学生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州341000 2022
Subjects
甜橙;SPL基因家族;生物信息学;基因表达;成花诱导
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ISSN1000-4025
DOI10.7606/j.issn.1000-4025.2022.01.0048

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Abstract Q786%Q789; SQUAMOSA promoter binding protein like(SPL)基因家族在植物成花转变与花器发育中起重要调控作用.该研究基于甜橙(Citrus sinensis)基因组数据,对甜橙SPL家族成员及其启动子区进行生物信息学分析,并采用qRT PCR检测其在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片的表达特异性,为深入探讨CsSPLs基因在甜橙成花诱导中的功能奠定基础.结果 表明:(1)共鉴定出15个含有SBP保守结构域的甜橙SPL基因,分别命名为CsSPL1～CsSPL15,且分布在6条染色体上.(2)CsSPL1～CsSPL15基因编码的氨基酸长度为130～1075 aa,分子量为14.73～118.75 kD;系统发育分析将15个CsSPLs分成8个亚族,除CsSPL4外,其他CsSPLs均与拟南芥SPL家族成员聚类.(3)顺式作用元件分析表明,CsSPLs启动子中含有大量光响应元件,推测CsSPLs可能在甜橙响应光调控过程中发挥重要作用.(4)转录组数据分析显示,CsSPLs在甜橙愈伤组织、花、叶片和果实中均有表达,其中CsSPL 3、CsSPL4、CsSPL7、CsSPL8、CsSPL 12、CsSPL 13、CsSPL14和CsSPL 15在花和叶片中较高表达.(5)qRT PCR检测显示,CsSPLs在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片组织中的表达均有显著上调趋势,且采样各时期下早花品种'赣南早'花芽和叶片中CsSPLs的表达量均高于对照品种'纽荷尔'.研究认为,甜橙成花组织内CsSPLs基因的高表达是其花期提前的主要因素.
AbstractList Q786%Q789; SQUAMOSA promoter binding protein like(SPL)基因家族在植物成花转变与花器发育中起重要调控作用.该研究基于甜橙(Citrus sinensis)基因组数据,对甜橙SPL家族成员及其启动子区进行生物信息学分析,并采用qRT PCR检测其在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片的表达特异性,为深入探讨CsSPLs基因在甜橙成花诱导中的功能奠定基础.结果 表明:(1)共鉴定出15个含有SBP保守结构域的甜橙SPL基因,分别命名为CsSPL1～CsSPL15,且分布在6条染色体上.(2)CsSPL1～CsSPL15基因编码的氨基酸长度为130～1075 aa,分子量为14.73～118.75 kD;系统发育分析将15个CsSPLs分成8个亚族,除CsSPL4外,其他CsSPLs均与拟南芥SPL家族成员聚类.(3)顺式作用元件分析表明,CsSPLs启动子中含有大量光响应元件,推测CsSPLs可能在甜橙响应光调控过程中发挥重要作用.(4)转录组数据分析显示,CsSPLs在甜橙愈伤组织、花、叶片和果实中均有表达,其中CsSPL 3、CsSPL4、CsSPL7、CsSPL8、CsSPL 12、CsSPL 13、CsSPL14和CsSPL 15在花和叶片中较高表达.(5)qRT PCR检测显示,CsSPLs在甜橙不同花期、不同品种花芽和叶片组织中的表达均有显著上调趋势,且采样各时期下早花品种'赣南早'花芽和叶片中CsSPLs的表达量均高于对照品种'纽荷尔'.研究认为,甜橙成花组织内CsSPLs基因的高表达是其花期提前的主要因素.
Author 吴巧玲
胡文娟
陈蓉
李兴涛
杨杰
陈健美
AuthorAffiliation 赣南师范大学生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州341000
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