通过WGCNA建立食管鳞癌放射敏感性的microRNA表达模型

R735.1; 目的 筛选并验证影响食管鳞癌放射敏感性的microRNAs.方法 基于TCGA数据库及食管鳞癌患者的组织标本,利用WGCNA算法及qRT-PCR筛选并验证放射敏感相关的核心microRNAs.Logistic联合ROC评估预测模型的准确性.克隆形成实验验证microRNAs对食管鳞癌放射敏感性的影响.TargetScan及Western blotting验证microRNAs与靶基因之间的相关性.结果 WGCNA筛选出食管鳞癌放射敏感相关的4个核心microRNAs;qRT-PCR发现,miR-29b-3p、miR-146b-5p及miR-155-5p在食管鳞癌放射抗拒细胞株中...

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Published in西安交通大学学报（医学版） Vol. 41; no. 5; pp. 645 - 658
Main Authors 孙宇晨, 孙玄子, 李静, 师小博, 赵旭, 苏亚妮, 张晓智, 杨蕴一
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 西安交通大学第一附属医院肿瘤放疗科,陕西西安 710061%延安大学附属医院肿瘤放疗科,陕西延安 716000 05.09.2020
Subjects
食管鳞癌
microRNA
放射敏感性
WGCNA
DNA损伤修复
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ISSN1671-8259
DOI10.7652/jdyxb202005003

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Summary:R735.1; 目的 筛选并验证影响食管鳞癌放射敏感性的microRNAs.方法 基于TCGA数据库及食管鳞癌患者的组织标本,利用WGCNA算法及qRT-PCR筛选并验证放射敏感相关的核心microRNAs.Logistic联合ROC评估预测模型的准确性.克隆形成实验验证microRNAs对食管鳞癌放射敏感性的影响.TargetScan及Western blotting验证microRNAs与靶基因之间的相关性.结果 WGCNA筛选出食管鳞癌放射敏感相关的4个核心microRNAs;qRT-PCR发现,miR-29b-3p、miR-146b-5p及miR-155-5p在食管鳞癌放射抗拒细胞株中表达下调.miR-29b-3p、miR-146b-5p联合miR-155-5p可较准确地预测食管鳞癌放射敏感性.诺曼图结果提示,miR-29b-3p是影响晚期食管鳞癌患者预后的最重要因素.过表达miR-29b-3p、miR-146b-5p可抑制食管鳞癌细胞的体外增殖力并增强其放射敏感性.TargetScan数据库及Western blotting结果提示,miR-29b-3p与miR-146b-5p分别靶向作用于H2AX和ATR的mRNA,抑制电离辐射后细胞内γH2AX和ATR的表达.结论 依据miR-29b-3p、miR-146b-5p及miR-155-5p可较好地预测食管鳞癌患者的放疗效果;miR-29b-3p、miR-146b-5p通过分别靶向作用于DNA损伤识别蛋白ATR及H2AX,发挥放射增敏作用.
ISSN:1671-8259
DOI:10.7652/jdyxb202005003