鬼箭羽通过调节EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路延缓糖尿病肾病的进展

目的 结合GEO数据库利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制.方法 通过TCMSP、PubChem及Swiss Target Prediction数据库获取鬼箭羽的活性成分和作用靶点.利用GEO数据库找出与DKD相关基因芯片,使用R语言分析筛选出差异表达基因,结合GeneCards、DisGeNet、OMIM以及TTD疾病数据库整合获取DKD的治疗靶点.利用Venny2.1.0平台将药物与DKD相关的靶基因取交,利用STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络图,并利用Cytoscape3.8.2软件进行核心靶点的拓扑属性分析以及"药物-成分...

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Published in南方医科大学学报 Vol. 44; no. 7; pp. 1243 - 1255
Main Authors 王瑾瑾, 崔文飞, 窦雪伟, 尹冰磊, 牛钰琪, 牛羚, 闫国立
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 河南中医药大学医学院,河南 郑州 450046 2024
Subjects
糖尿病肾病
网络药理学
diabetic kidney disease
GEO database
动物实验
GEO数据库
animal experiments
euonymus alatus
molecular docking
signaling pathways
network pharmacology
信号通路
鬼箭羽
分子对接
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ISSN1673-4254
DOI10.12122/j.issn.1673-4254.2024.07.04

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Summary:目的 结合GEO数据库利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究鬼箭羽治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制.方法 通过TCMSP、PubChem及Swiss Target Prediction数据库获取鬼箭羽的活性成分和作用靶点.利用GEO数据库找出与DKD相关基因芯片,使用R语言分析筛选出差异表达基因,结合GeneCards、DisGeNet、OMIM以及TTD疾病数据库整合获取DKD的治疗靶点.利用Venny2.1.0平台将药物与DKD相关的靶基因取交,利用STRING平台构建蛋白-蛋白互作网络图,并利用Cytoscape3.8.2软件进行核心靶点的拓扑属性分析以及"药物-成分-靶点-疾病"网络图构建;利用David平台进行KEGG与GO分析.利用Autodock vina V1.2.0软件对核心靶点及主要药效成分进行分子对接,并通过db小鼠动物实验进一步加以验证.结果 符合条件的基因芯片为GSE96804、GSE30528和GSE30529,共包含60例患病和45例正常样本数据,R语言分析得到111个差异基因.网络药理学分析显示鬼箭羽相关靶基因共226种,DKD相关靶基因共4252种,二者取交得到鬼箭羽治疗DKD的潜在靶基因共161种;PPI网络图中筛选出关键核心靶基因为SRC、EGFR、AKT1等,"药物-成分-靶点-疾病"网络图得到鬼箭羽的主要核心活性成分为槲皮素、山奈酚、香叶木素、柚皮素.GO和KEGG富集分析显示,鬼箭羽治疗DKD的生物过程与外源刺激的反应、蛋白质磷酸化等有关,可能主要通过调节EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药通路发挥作用.分子对接结果显示鬼箭羽的主要核心活性成分与关键核心靶点具有良好的结合活性.体内动物实验结果证明鬼箭羽能够改善肾脏组织的病理学变化,且显著抑制了SRC、EGFR、AKT1的表达(P<0.05),延缓DKD的进一步恶化.结论 鬼箭羽可能是通过槲皮素、山奈酚、香叶木素、柚皮素等多种活性成分调控SRC、EGFR、AKT1等基因表达,从而影响EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药信号通路治疗DKD.
ISSN:1673-4254
DOI:10.12122/j.issn.1673-4254.2024.07.04