苦荞FtWRKY28基因克隆及其在低磷与激素诱导下的表达分析

Q943.2%S517; [目的]WRKY转录因子参与植物对低磷胁迫反应的调控.基于前期苦荞在低磷胁迫下的转录组数据,克隆FtWRKY28基因,预测基因及其编码蛋白的序列结构特征,分析基因在各器官中以及在低磷和激素处理下的表达模式、蛋白的亚细胞定位与转录激活活性,为阐明基因的生物学功能奠定基础.[方法]基于苦荞基因组数据库注释设计特异引物,用逆转录PCR从低磷处理的苦荞根RNA样中克隆FtWRKY28的完整编码序列,用生物信息学方法分析基因与蛋白的结构以及同源蛋白的进化关系,用实时荧光定量分析基因的表达模式,用拟南芥原生质体瞬时表达体系分析蛋白的亚细胞定位,用酵母单杂交分析蛋白的转录激活活性....

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Published in西北植物学报 Vol. 44; no. 6; pp. 930 - 937
Main Authors 文碧瑶, 彭喜旭, 田建红, 邬清韬, 王海华, 唐新科
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭 411201%湖南科技大学生命科学与健康学院,湖南湘潭 411201 2024
经济作物遗传改良与综合利用湖南省重点实验室,湖南湘潭 411201
重金属污染土壤生态修复与安全利用湖南省高校重点实验室,湖南湘潭 411201
Subjects
低磷胁迫
low phosphorus stress
WRKY gene
结构预测
Fagopyrum tataricum Gaertn
苦荞
WRKY基因
基因表达
生化特征
struc-ture prediction
gene expression
biochemical characteristics
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ISSN1000-4025
DOI10.7606/j.issn.1000-4025.20230313

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Summary:Q943.2%S517; [目的]WRKY转录因子参与植物对低磷胁迫反应的调控.基于前期苦荞在低磷胁迫下的转录组数据,克隆FtWRKY28基因,预测基因及其编码蛋白的序列结构特征,分析基因在各器官中以及在低磷和激素处理下的表达模式、蛋白的亚细胞定位与转录激活活性,为阐明基因的生物学功能奠定基础.[方法]基于苦荞基因组数据库注释设计特异引物,用逆转录PCR从低磷处理的苦荞根RNA样中克隆FtWRKY28的完整编码序列,用生物信息学方法分析基因与蛋白的结构以及同源蛋白的进化关系,用实时荧光定量分析基因的表达模式,用拟南芥原生质体瞬时表达体系分析蛋白的亚细胞定位,用酵母单杂交分析蛋白的转录激活活性.[结果]FtWRKY28的完整编码序列长876 bp,编码1个含291个氨基酸、有1个WRKY结构域、锌指结构域为C2 H2型的蛋白,归属WRKY家族Ⅱ组.FtWRKY28绝大部分定位于细胞核,具有转录激活活性.FtWRKY28在根中表达水平最高,受低磷、吲哚乙酸、赤霉素3和6-苄氨基嘌呤显著诱导.[结论]FtWRKY28具有转录因子的基本结构与生物化学特征,可能通过生长素、赤霉素、细胞分裂素信号网络的交互作用,调控苦荞在低磷胁迫下的响应过程.
ISSN:1000-4025
DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.20230313