肺癌患者外周血和胸腔积液T细胞受体组库特征分析

• Published in: 中国临床医学 Vol. 31; no. 1; pp. 60 - 67
• Main Authors: 宋娟, 王林林, 胡洁, 宋元林, 童琳
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科,上海 200032 01.02.2024; 上海市重大传染病与生物安全研究院,上海 200032%复旦大学附属中山医院呼吸与危重症医学科,上海 200032
• Subjects: lung cancer; 多样性; malignant pleural effusion; T cell receptor repertoire; 肺癌; 恶性胸腔积液; diversity; pleural effusion mononuclear cell; 胸腔积液单个核细胞; 外周血单个核细胞; peripheral blood mononuclear cell; T细胞受体组库
• ISSN: 1008-6358
• DOI: 10.12025/j.issn.1008-6358.2024.20231869

R734.2; 目的 比较肺癌患者外周血和胸腔积液的T细胞受体(TCR)组库的免疫学特征.方法 收集2020年7月至2021年1月在复旦大学附属中山医院就诊的5例合并恶性胸腔积液肺癌患者的外周血和胸腔积液,分离外周血单个核细胞(PBMC)和胸腔积液单个核细胞(PEMC),提取基因组DNA,采用Illumina MiSeq平台对TCR进行高通量测序,分析TCR组库的多样性等特征.结果 PBMC和PEMC中的TCR克隆型、VJ pairs和互补决定区3(CDR3)序列的多样性和相关性差异均无统计学意义.PBMC中检测到的TCR克隆数量高于PEMC(P<0.05),VJ pairs和CDR3数量与PEMC差异无统计学意义.PBMC和PEMC配对样本的共有VJ pairs数量占总VJ pairs的比例高于共有克隆型和CDR3序列的数量比例(P<0.05),后两者差异无统计学意义.PEMC中高扩增克隆(HEC)数量和占比均高于PBMC.同时鉴定了36个在PBMC和PEMC中差异表达的VJ pairs,其中25个在PEMC中表达升高、9个在PEMC中表达降低.结论 肺癌患者外周血和胸腔积液的TCR组库表现出不同的特征性变化,可能为肺癌重要的免疫病理学特征.