基于分子动力学模拟的扩展青霉棒曲霉素MFS蛋白转运机制研究

Q963; 扩展青霉可产生具有毒性的次生代谢产物—棒曲霉素.PatC基因编码MFS转运蛋白将棒曲霉素的前体物质转运至胞外,在棒曲霉素防治中具有较高的参考价值.为研究PatC蛋白的转运机制,利用生物信息学方法预测PatC的空间结构,采用分子对接和分子动力学模拟解析棒曲霉素前体分子(E-ascladiol)与PatC的作用位点及可能的作用机制.结果表明,该蛋白含有 546个氨基酸,含有 14个跨膜螺旋且具有MFS功能结构域;分子对接结果显示,该蛋白与E-ascladiol存在 4个结合位点,分别为SER353、TYR336、PRO339、PRO188.针对Wild蛋白复合体系及P188A突变体系进...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in食品工业科技 Vol. 44; no. 18; pp. 200 - 208
Main Authors 杨琪, 王艳玲
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 兰州理工大学生命科学与工程学院,甘肃兰州 730050 01.09.2023
Subjects
Penicillium expansum
MFS转运蛋白
molecular docking
MFS transporter
patulin(PAT)
分子动力学
扩展青霉
棒曲霉素
molecular dynamics
分子对接
Online AccessGet full text
ISSN1002-0306
DOI10.13386/j.issn1002-0306.2022110341

Cover

More Information
Summary:Q963; 扩展青霉可产生具有毒性的次生代谢产物—棒曲霉素.PatC基因编码MFS转运蛋白将棒曲霉素的前体物质转运至胞外,在棒曲霉素防治中具有较高的参考价值.为研究PatC蛋白的转运机制,利用生物信息学方法预测PatC的空间结构,采用分子对接和分子动力学模拟解析棒曲霉素前体分子(E-ascladiol)与PatC的作用位点及可能的作用机制.结果表明,该蛋白含有 546个氨基酸,含有 14个跨膜螺旋且具有MFS功能结构域;分子对接结果显示,该蛋白与E-ascladiol存在 4个结合位点,分别为SER353、TYR336、PRO339、PRO188.针对Wild蛋白复合体系及P188A突变体系进行 200 ns的分子动力学模拟,结果显示小分子底物与PatC结合紧密,且位于氨基酸序列Pro188～Ser197aa和Gly231～Val241aa区域内形成复合体后,蛋白的柔性发生强烈变化,由此可推测这两个区域可能存在作用位点.通过对P188A突变体系的各参数数据的分析,可以预测PRO188作为PatC的重要靶点,为后续的分子实验提供基础理论.该研究结果为探索棒曲霉素的转运机制奠定基础,为防治苹果腐烂提供了新策略.
ISSN:1002-0306
DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2022110341