结直肠癌肿瘤相关成纤维细胞对免疫治疗和肝转移的影响
目的 探讨结直肠癌 (CRC) 中肿瘤相关成纤维细胞 (CAF) 对免疫治疗和肝转移的影响。 方法 从基因表达数据库 (GEO) 中下载错配修复缺陷 (MMRd) 的CRC患者相关的单细胞测序数据 (GSE205506) ,利用R软件对原始测序数据进行预处理,建立CAF亚群降维图,并根据每个亚群的标志性基因对亚群进行命名,使用GraphPad对每种亚群的比例进行统计,分析CRC患者在程序性死亡受体1 (PD-1) 免疫治疗前后以及治疗后病理完全缓解 (pCR) 与病理未完全缓解 (non-pCR) 患者中具有明显差异的关键亚群,对关键亚群进行差异基因分析和基因通路富集分析,利用肿瘤基因组图谱...
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| Published in | Linchuang gandanbing zazhi Vol. 40; no. 6; pp. 1183 - 1190 |
|---|---|
| Main Authors | , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
Changchun
Journal of Clinical Hepatology
01.06.2024
华南理工大学医学院,广州 510006%广东省人民医院心血管病研究所,广州 510080 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1001-5256 2097-3497 |
| DOI | 10.12449/JCH240618 |
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| Summary: | 目的 探讨结直肠癌 (CRC) 中肿瘤相关成纤维细胞 (CAF) 对免疫治疗和肝转移的影响。 方法 从基因表达数据库 (GEO) 中下载错配修复缺陷 (MMRd) 的CRC患者相关的单细胞测序数据 (GSE205506) ,利用R软件对原始测序数据进行预处理,建立CAF亚群降维图,并根据每个亚群的标志性基因对亚群进行命名,使用GraphPad对每种亚群的比例进行统计,分析CRC患者在程序性死亡受体1 (PD-1) 免疫治疗前后以及治疗后病理完全缓解 (pCR) 与病理未完全缓解 (non-pCR) 患者中具有明显差异的关键亚群,对关键亚群进行差异基因分析和基因通路富集分析,利用肿瘤基因组图谱 (TCGA) 数据库对关键CAF亚群的标志性基因进行预后生存分析,通过RNA测序数据对CRC肝转移患者原发灶中关键CAF亚群进行评分和比例计算。符合正态分布的计量资料两组间比较采用成组t检验,Kaplan-Meier法绘制生存曲线,Log-rank检验比较生存率。利用CellPhoneDB软件分析成纤维细胞亚群与肿瘤细胞间的受配体相互作用,并通过体外细胞实验验证关键配体分子NRG1对CRC细胞迁移侵袭能力的影响。 结果 CRC患者经过PD-1免疫治疗后,F6_MMP1+CAF比例减少 (P<0.001) ,但这种减少只发生在免疫治疗后完全缓解的患者中,F6_MMP1+CAF与肿瘤迁移和侵袭相关的基因及信号通路表达上调,此外,F6_MMP1+CAF在CRC肝转移患者肿瘤组织中明显增多 (P<0.000 1) 。F6_MMP1+CAF表达的NRG1作为配体与肿瘤细胞表达的ERBB3受体相互作用,体外实验证明NRG1通过激活ERBB信号通路促进肿瘤细胞的迁移和侵袭 (P<0.05) 。 结论 F6_MMP1+CAF可能影响CRC患者PD-1免疫治疗的效果,并在促进CRC发生肝转移过程中发挥重要作用,F6_MMP1+CAF及产生的促肿瘤转移的NRG1或许可以作为潜在的CRC治疗靶点及预后标志物。 |
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| Bibliography: | ObjectType-Article-1 SourceType-Scholarly Journals-1 ObjectType-Feature-2 content type line 14 |
| ISSN: | 1001-5256 2097-3497 |
| DOI: | 10.12449/JCH240618 |