ELASTomics：細胞の力学特性と遺伝子発現の統合解析法

「1. はじめに」老化やがん, 細胞分化といった様々な生命現象における細胞の力学特性とそれが生命現象において果たす役割について研究する学問領域であるセルメカニクスは, 2000年頃から飛躍的に発展してきた. 近年では重要な制御因子についても同定され始め根本的なメカニズムの理解が進みつつあるが, 遺伝子発現変動と細胞の力学特性を繋ぐ分子カスケードについては未だ不明な点が多い. 「2. ELASTomicsの開発」そこで著者らは細胞表面張力と遺伝子発現解析を組み合わせることが可能な新しい手法を開発し, ELASTomics (Electroporation-based Lipid-bilayer...

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Published in生物物理 Vol. 65; no. 1; pp. 17 - 19
Main Authors 土田, 新, 金子, 泰洸ポール, 新宅, 博文, 塩見, 晃史, 西川, 香里
Format Journal Article
LanguageJapanese
Published 一般社団法人 日本生物物理学会 2025
日本生物物理学会
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ISSN0582-4052
1347-4219
DOI10.2142/biophys.65.17

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Abstract 「1. はじめに」老化やがん, 細胞分化といった様々な生命現象における細胞の力学特性とそれが生命現象において果たす役割について研究する学問領域であるセルメカニクスは, 2000年頃から飛躍的に発展してきた. 近年では重要な制御因子についても同定され始め根本的なメカニズムの理解が進みつつあるが, 遺伝子発現変動と細胞の力学特性を繋ぐ分子カスケードについては未だ不明な点が多い. 「2. ELASTomicsの開発」そこで著者らは細胞表面張力と遺伝子発現解析を組み合わせることが可能な新しい手法を開発し, ELASTomics (Electroporation-based Lipid-bilayer Assay for cell Surface Tension and transcriptomics) と命名した. ELASTomicsとは, ナノポアエレクトロポレーション (NanoEP) により細胞内へ物質輸送されたDNAタグ付きデキストラン (DTD : DNA-tagged dextran) のバーコード配列を1細胞RNA-seqで読み出すことにより, 細胞の遺伝子発現と細胞表面張力の測定を同時かつ大規模にできる新しい解析法である.
AbstractList 著者らは細胞の力学特性である細胞表面張力と遺伝子発現を1細胞レベルで大規模解析することが可能な新規手法であるELASTomics法を開発した．この方法を用いて老化細胞の細胞表面張力と遺伝子発現の相関を調べた結果，RRADが老化に伴う細胞表面張力の増加を制御していることを明らかにした．
「1. はじめに」老化やがん, 細胞分化といった様々な生命現象における細胞の力学特性とそれが生命現象において果たす役割について研究する学問領域であるセルメカニクスは, 2000年頃から飛躍的に発展してきた. 近年では重要な制御因子についても同定され始め根本的なメカニズムの理解が進みつつあるが, 遺伝子発現変動と細胞の力学特性を繋ぐ分子カスケードについては未だ不明な点が多い. 「2. ELASTomicsの開発」そこで著者らは細胞表面張力と遺伝子発現解析を組み合わせることが可能な新しい手法を開発し, ELASTomics (Electroporation-based Lipid-bilayer Assay for cell Surface Tension and transcriptomics) と命名した. ELASTomicsとは, ナノポアエレクトロポレーション (NanoEP) により細胞内へ物質輸送されたDNAタグ付きデキストラン (DTD : DNA-tagged dextran) のバーコード配列を1細胞RNA-seqで読み出すことにより, 細胞の遺伝子発現と細胞表面張力の測定を同時かつ大規模にできる新しい解析法である.
Author 金子, 泰洸ポール
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