MicroRNA-338与靶蛋白eiF4E3的相互作用研究

R743.3; 目的:分析脑缺血再灌注损伤中MicroRNA-338的关键靶蛋白,并探讨MicroRNA调控其靶蛋白的作用及影响因素.方法:采用生物信息学软件预测microRNA-338的可能靶蛋白,根据所预测靶蛋白的mRNA 3′UTR二级结构(RNA structure 4.6 软件预测)及其在脑缺血再灌注损伤中的作用,确定关键靶蛋白.通过双荧光酶报告系统检验microRNA-338与靶蛋白3′UTR的相互识别;采用Western blot检测实验组与对照组eiF4E3的表达变化.结果:eiF4E3可能是microRNA-338的关键靶蛋白,且其与microRNA-338识别的局部RNA二...

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Published in浙江大学学报(医学版) Vol. 39; no. 6; pp. 583 - 588
Main Authors 何谦益, 彭国平, 刘伟霞, 罗本燕
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 浙江大学医学院附属第一医院神经内科,浙江,杭州,310003%浙江大学医学院附属第一医院传染病诊治国家重点实验室,浙江,杭州,310003 2010
Subjects
eiF4E3
基因表达调控
靶蛋白识别
脑缺血
再灌注损伤
基因,调节
MicroRNA-338
靶蛋白识别后调节
微RNAs
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ISSN1008-9292
DOI10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006

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Summary:R743.3; 目的:分析脑缺血再灌注损伤中MicroRNA-338的关键靶蛋白,并探讨MicroRNA调控其靶蛋白的作用及影响因素.方法:采用生物信息学软件预测microRNA-338的可能靶蛋白,根据所预测靶蛋白的mRNA 3′UTR二级结构(RNA structure 4.6 软件预测)及其在脑缺血再灌注损伤中的作用,确定关键靶蛋白.通过双荧光酶报告系统检验microRNA-338与靶蛋白3′UTR的相互识别;采用Western blot检测实验组与对照组eiF4E3的表达变化.结果:eiF4E3可能是microRNA-338的关键靶蛋白,且其与microRNA-338识别的局部RNA二级结构保持不变.细胞荧光检测结果显示,萤火虫荧光在实验组的表达较对照组显著上升(P<0.01);而海肾荧光在实验组的表达与对照组相比较,差异无统计学意义(P>0.05).Western blot显示,实验组和对照组eiF4E3的表达无并无显著性差异(P>0.05).结论:microRNA-338可以识别eiF4E3 mRNA的3′UTR,但对eiF4E3的表达水平并无显著影响.在microRNA识别其目的靶蛋白mRNA后存在影响microRNA与靶蛋白mRNA相互作用的因素,而这种因素很可能与mRNA的三级结构有关.
ISSN:1008-9292
DOI:10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006