小麦雌性育性QTL的高效定位策略

为了高效地定位小麦雌性育性QTL，以选择表型及连锁不平衡结合策略筛选候选标记．对选取的SSR标记在实验群体中以隐性极端不育亚群体估算其重组频率（c值），确定染色体2AS、2DS上可能存在QTL．再对候选染色体上18个标记分别计算c值，并用育成品种与小麦雌性不育系XND126组成的品种（系）群体计算标记与可能位点间的连锁不平衡值（LD值）．结合c值和LD值提供的位点信息构建部分连锁群，通过实验群体F2的连锁分析定位了小麦雌性育性位点taf1．结果发现与taf1位点连锁较紧密的标记，其c值较小而LD值较大．分析认为结合连锁分析和关联分析优势，同时选择c值较小而LD值较大的多态性标记有利于快速确定与...

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Published inZhejiang daxue xue bao. Journal of Zhejiang University. Agriculture and life sciences. Nong ye yu sheng ming ke xue ban Vol. 35; no. 6; pp. 599 - 606
Main Author 窦秉德 侯北伟 徐海明 朱晓滨 徐海风
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 新疆农业大学,农学院,新疆,乌鲁木齐,830052%浙江大学,农业与生物技术学院,浙江,杭州,310029 2009
淮阴师范学院,植物生物技术研究所,江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223300
Subjects
QTL定位
小麦
连锁不平衡
选择表型
雌性不育
QTL定位
小麦
选择表型
连锁不平衡
雌性不育
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ISSN1008-9209
DOI10.3785/j.issn.1008-9209.2009.06.002

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Abstract 为了高效地定位小麦雌性育性QTL，以选择表型及连锁不平衡结合策略筛选候选标记．对选取的SSR标记在实验群体中以隐性极端不育亚群体估算其重组频率（c值），确定染色体2AS、2DS上可能存在QTL．再对候选染色体上18个标记分别计算c值，并用育成品种与小麦雌性不育系XND126组成的品种（系）群体计算标记与可能位点间的连锁不平衡值（LD值）．结合c值和LD值提供的位点信息构建部分连锁群，通过实验群体F2的连锁分析定位了小麦雌性育性位点taf1．结果发现与taf1位点连锁较紧密的标记，其c值较小而LD值较大．分析认为结合连锁分析和关联分析优势，同时选择c值较小而LD值较大的多态性标记有利于快速确定与位点紧密连锁的标记，从而达到高效定位QTL的目的，并有助于揭示小麦雌性育性的遗传机制．
AbstractList Q943%S512.1; 为了高效地定位小麦雌性育性QTL,以选择表型及连锁不平衡结合策略筛选候选标记.对选取的SSR标记在实验群体中以隐性极端不育亚群体估算其重组频率(c值),确定染色体2AS、2DS上可能存在QTL.再对候选染色体上18个标记分别计算c值,并用育成品种与小麦雌性不育系XND126组成的品种(系)群体计算标记与可能位点间的连锁不平衡值(LD值).结合c值和LD值提供的位点信息构建部分连锁群,通过实验群体F_2的连锁分析定位了小麦雌性育性位点taf1.结果发现与taf1位点连锁较紧密的标记,其c值较小而LD值较大.分析认为结合连锁分析和关联分析优势,同时选择c值较小而LD值较大的多态性标记有利于快速确定与位点紧密连锁的标记,从而达到高效定位QTL的目的,并有助于揭示小麦雌性育性的遗传机制.
为了高效地定位小麦雌性育性QTL，以选择表型及连锁不平衡结合策略筛选候选标记．对选取的SSR标记在实验群体中以隐性极端不育亚群体估算其重组频率（c值），确定染色体2AS、2DS上可能存在QTL．再对候选染色体上18个标记分别计算c值，并用育成品种与小麦雌性不育系XND126组成的品种（系）群体计算标记与可能位点间的连锁不平衡值（LD值）．结合c值和LD值提供的位点信息构建部分连锁群，通过实验群体F2的连锁分析定位了小麦雌性育性位点taf1．结果发现与taf1位点连锁较紧密的标记，其c值较小而LD值较大．分析认为结合连锁分析和关联分析优势，同时选择c值较小而LD值较大的多态性标记有利于快速确定与位点紧密连锁的标记，从而达到高效定位QTL的目的，并有助于揭示小麦雌性育性的遗传机制．
Author 窦秉德 侯北伟 徐海明 朱晓滨 徐海风
AuthorAffiliation 淮阴师范学院植物生物技术研究所江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏淮安223300 新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐830052 浙江大学农业与生物技术学院,浙江杭州310029
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Notes selective phenotyping
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wheat ; female fertility; selective phenotyping; linkage disequilibrium; QTL mapping
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PublicationYear 2009
Publisher 新疆农业大学,农学院,新疆,乌鲁木齐,830052%浙江大学,农业与生物技术学院,浙江,杭州,310029
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