小球藻属DNA条形码的鉴定研究
为探讨小球藻鉴定的新方法以及评估小球藻属DNA条形码候选序列的鉴定作用，文章对20株小球藻的线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COI）、核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）以及核酮糖1，5-二磷酸羧化酶（rbcL）3个片段进行PCR扩增测序，并对各序列进行生物信息学分析。研究结果表明：COI、ITS和rbcL序列在20株小球藻中的扩增和测序效率均呈阳性，扩增成功率分别为76%、83%和70%；经评估，COI、ITS和rbcL序列作为DNA条形码在小球藻分类鉴定中均不适合较低的分类单位，但可参考动植物的分类方法，将多个片段组合应用，从而筛选不同进化级别的DNA条形码。...
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| Published in | 海洋开发与管理 Vol. 38; no. 2; pp. 69 - 76 |
|---|---|
| Main Authors | , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
海洋出版社有限公司
28.02.2021
自然资源部北部湾滨海湿地生态系统野外科学观测研究站 北海 536015 自然资源部第三海洋研究所 厦门 361005%自然资源部第三海洋研究所 厦门 361005 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1005-9857 |
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| Abstract | 为探讨小球藻鉴定的新方法以及评估小球藻属DNA条形码候选序列的鉴定作用，文章对20株小球藻的线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COI）、核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）以及核酮糖1，5-二磷酸羧化酶（rbcL）3个片段进行PCR扩增测序，并对各序列进行生物信息学分析。研究结果表明：COI、ITS和rbcL序列在20株小球藻中的扩增和测序效率均呈阳性，扩增成功率分别为76%、83%和70%；经评估，COI、ITS和rbcL序列作为DNA条形码在小球藻分类鉴定中均不适合较低的分类单位，但可参考动植物的分类方法，将多个片段组合应用，从而筛选不同进化级别的DNA条形码。 |
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| AbstractList | Q949.21; 为探讨小球藻鉴定的新方法以及评估小球藻属DNA条形码候选序列的鉴定作用,文章对20株小球藻的线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)、核基因组rDNA的内转录间隔区(ITS)以及核酮糖1,5-二磷酸羧化酶(rbcL)3个片段进行PCR扩增测序,并对各序列进行生物信息学分析.研究结果表明:COI、ITS和rbcL序列在20株小球藻中的扩增和测序效率均呈阳性,扩增成功率分别为76％、83％和70％;经评估,COI、ITS和rbcL序列作为DNA条形码在小球藻分类鉴定中均不适合较低的分类单位,但可参考动植物的分类方法,将多个片段组合应用,从而筛选不同进化级别的DNA条形码. 为探讨小球藻鉴定的新方法以及评估小球藻属DNA条形码候选序列的鉴定作用，文章对20株小球藻的线粒体基因细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COI）、核基因组rDNA的内转录间隔区（ITS）以及核酮糖1，5-二磷酸羧化酶（rbcL）3个片段进行PCR扩增测序，并对各序列进行生物信息学分析。研究结果表明：COI、ITS和rbcL序列在20株小球藻中的扩增和测序效率均呈阳性，扩增成功率分别为76%、83%和70%；经评估，COI、ITS和rbcL序列作为DNA条形码在小球藻分类鉴定中均不适合较低的分类单位，但可参考动植物的分类方法，将多个片段组合应用，从而筛选不同进化级别的DNA条形码。 |
| Author | 张稚兰 邢炳鹏 |
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| PublicationTitle_FL | Ocean Development and Management |
| PublicationYear | 2021 |
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